Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G03140
Type: Protein GRN ID: np11432 Name:
Annotation: splicing factor Prp18 family protein
Gene Locus: AT1G03140
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 263116_s_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
3 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050
4 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190
5 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810
6 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G66560
7 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110
8 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT4G33690
9 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  NPL1; PHOT2
10 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G05190
11 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G65683
12 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G19960
13 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ALF4
14 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G52010
15 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G49210
16 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G30860
17 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  JAI3
18 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT2G32840
19 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
20 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT2G39100
21 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G15200
22 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  PYM; UVI4
23 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  IMPA-2
24 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT4G02720
25 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT3G11590
26 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G49850
27 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ATMAP70-2; MAP70-2
28 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT2G22680
29 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  OBE1
30 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ATMAP70-1; MAP70-1
31 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.862338) with  --  CYP705A8
32 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.840893) with  --  ATMLP-300B; MEE36; MLP-300B
33 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.870371) with  --  AT3G01190
34 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.853208) with  --  ATHB20; HB20
35 AT1G03140  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.820123) with  --  AT3G59370
36 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  KAN; KAN1
37 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G37550
38 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  VPS20.2
39 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G58950
40 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G57910
41 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G22890
42 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G11090
43 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATPUB49; PUB49
44 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G63350
45 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G55890
46 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G31870
47 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
48 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G35240
49 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  TTL3; VIT
50 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G71020
51 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G43370
52 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CYCA2;3
53 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
54 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATSIG6; SIG6; SIGF; SOLDAT8
55 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G48280
56 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G33920
57 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G60200
58 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G32590
59 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  MOS1
60 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G17670
61 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G61590
62 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
63 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G71970
64 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  DRIP2
65 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G13227
66 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATG8D
67 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G28230
68 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G53800
69 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G24740
70 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G65495
71 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  TIFY8
72 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G52650
73 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G09450
74 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G59210
75 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  OBF5
76 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  PSL4
77 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AtMYB51; BW51A; BW51B; HIG1; MYB51
78 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G68590
79 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
80 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G27420
81 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
82 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
83 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT4G17680
84 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G22440
85 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
86 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G01630
87 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G04860
88 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G07840
89 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT4G14900
90 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G19010
91 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G15385
92 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATCYTC-A; CYTC-1
93 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATDGK3; DGK3
94 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  TRFL5
95 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G25420
96 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G08780
97 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G18260
98 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATNDPK2; NDPK IA; NDPK IA IA; NDPK1A; NDPK2
99 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  MED10A
100 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AtTHO5; THO5
101 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G58530
102 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G30490
103 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PFN3; PRF3
104 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
105 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  NFD1
106 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  CW7
107 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  SNRK2-10; SNRK2.10; SRK2B
108 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PFN2; PRF2; PRO2
109 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PYE
110 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G11550
111 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G30260
112 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ASP3; YLS4
113 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G70100
114 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT3G27350
115 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT2G16880
116 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
117 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ELF7
118 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT4G05400
119 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATWRKY17; WRKY17
120 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G58070
121 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G31240
122 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  SNZ
123 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G10060
124 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G66560  --  interacts with  --  AT5G66720
125 AT1G03140  --  interacts with  --  AT5G66560  --  interacts with  --  AT5G57860
126 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2
127 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  AT5G65400
128 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  CHY1
129 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  AT1G60010
130 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  AT2G25730
131 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  ATISU1; ISU1
132 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  ARR14
133 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  AT4G15545
134 AT1G03140  --  interacts with  --  AT4G35110  --  interacts with  --  AT3G20260
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact