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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ARF3
Type: Protein GRN ID: np02068 Name: ARF3
Annotation: ETT, ARF3 | Transcriptional factor B3 family protein / auxin-responsive factor AUX/IAA-related
Gene Locus: AT2G33860
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family ARF
References:
  • Sessions RA, Zambryski PC. Arabidopsis gynoecium structure in the wild and in ettin mutants. Development. 1995 May;121(5):1519-32. PubMed PMID: 7789281.
 
Pathways: Auxins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 267452_at    
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ARF3  --  is modified by  --  MPK16
3 ARF3  --  interacts with  --  IAA9
4 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD
5 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?
6 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4
7 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7
8 ARF3  --  is the target gene of  --  ATTAS3; TAS3; TASIR-ARF
9 ARF3  --  is the target gene of  --  TASIR-ARF
10 ARF3  --  is the target gene of  --  TAS3b
11 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene
12 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
13 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CDPK19; CPK8
14 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRL2; MEE3; RSM1
15 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  anac074; NAC074
16 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT4G08170
17 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  PFK3
18 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G38300
19 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPERK9; PERK9
20 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AMTK
21 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  KAN; KAN1
22 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G26695
23 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
24 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G35800
25 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G13670
26 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G71450
27 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RGL2
28 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G58730
29 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G02820
30 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  W-BOX
31 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  BUS1; CYP79F1; SPS1
32 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATMKK2; MK1; MKK2
33 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ASL29; LBD27; SCP
34 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G47660
35 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  LCL1
36 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G34450
37 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPP2-A13; PP2-A13
38 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G79020
39 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G20530
40 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  L1L; NF-YB6
41 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB116; MYB116
42 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CST; CX32
43 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G25560
44 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  SCL21
45 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  HEC3
46 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  TFIIIA
47 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB18; MYB18
48 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtTLP5; TLP5
49 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL50
50 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtWRKY22; WRKY22
51 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G21590
52 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G45680
53 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  MMZ2; UEV1B
54 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATELF5A-3; ELF5A-3
55 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RVE1
56 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATSUFE; CPSUFE; EMB1374; SUFE1
57 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G19520
58 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATHB-8; ATHB8; HB-8
59 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CYP705A20
60 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CRCK2
61 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G06590
62 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G27290
63 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL76
64 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G31390
65 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  DUO1
66 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G05260
67 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G01250
68 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRAB8D; ATRABE1B; RABE1b
69 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CIPK23?
70 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  NF-YA10
71 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G67530
72 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CKL6; PAPK1
73 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AHP1
74 ARF3  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATNIG1; NIG1
75 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  regulates the expression of   --  ARF18
76 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  ARF6
77 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA28
78 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA18
79 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA26; PAP1
80 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5
81 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA3
82 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  AXR5
83 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  ARF22
84 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  ARF5
85 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  ARF8
86 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
87 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA34
88 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA10
89 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA11
90 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  BDL
91 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA13
92 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA14
93 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA15
94 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA16
95 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  AXR3
96 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA19
97 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA8
98 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
99 ARF3  --  interacts with  --  IAA9  --  interacts with  --  IAA2
100 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD35
101 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD40
102 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HSI2; VAL1
103 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G51120
104 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G50680
105 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATE2FA; E2F3
106 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HMGB4; NFD04; NFD4
107 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP5
108 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT5G51910
109 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP16
110 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
111 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G72010
112 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP3
113 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  FAF1
114 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G76870
115 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
116 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
117 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT2G26940
118 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  KNAT3
119 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  anac046; NAC046
120 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL4
121 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL2
122 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TOE2
123 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  Rap2.6L
124 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP70; bZIP70
125 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATBZIP42; bZIP42
126 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP3; bZIP3
127 ARF3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LFY
128 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
129 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
130 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
131 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
132 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
133 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
134 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
135 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
136 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
137 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
138 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
139 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
140 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
141 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
142 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  anac032; NAC032
143 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
144 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
145 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
146 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
147 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
148 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
149 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
150 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
151 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
152 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
153 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
154 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
155 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
156 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
157 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
158 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
159 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
160 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
161 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
162 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
163 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
164 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
165 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
166 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
167 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
168 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
169 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
170 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
171 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
172 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
173 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  OBF4
174 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
175 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
176 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
177 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
178 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CO; FG
179 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  FCA
180 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
181 ARF3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BSH; CHE1
182 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.01563) with  --  AT2G25980
183 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.930848) with  --  AT1G33750
184 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.984984) with  --  AT3G15240
185 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.986894) with  --  AT1G31950
186 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.803854) with  --  AT5G05900
187 ARF3  --  interacts with  --  ATS; KAN4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.0194) with  --  AHK5; CKI2; HK5
188 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ATWRKY23; WRKY23
189 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ATCKX5
190 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ARF3; ARL1; ATARL1
191 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  AT4G12510
192 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ZFP6
193 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  LBD18
194 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  AT4G17350
195 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  BRL3
196 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  GH3.5
197 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ASL18; LBD16
198 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  AT5G02760
199 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  AT3G50340
200 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  GATA23
201 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ATZFP2; ZFP2
202 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  AT1G78110
203 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  AT1G29440
204 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  ATPIN1
205 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  regulates the expression of   --  GH3.2 ykd1/AUR3/bru6/gxh3-2
206 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA33
207 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA32; MEE10
208 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA31
209 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA30
210 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA29
211 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA20
212 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  IAA6; SHY1
213 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  AXR2
214 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  RPL24; RPL24B; STV1
215 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  ATL5; OLI5; PGY3; RPL5A
216 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  RGA1
217 ARF3  --  is regulated by  --  ARF7  --  interacts with  --  ARF20
218 ARF3  --  is the target gene of  --  ATTAS3; TAS3; TASIR-ARF  --  is the target gene of  --  ath-miR390b
219 ARF3  --  is the target gene of  --  ATTAS3; TAS3; TASIR-ARF  --  is the target gene of  --  ath-miR390a
220 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  BES1
221 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  is regulated by  --  IAA3 family34, transcription factor interactor and regulator gene
222 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  has family member  --  ARF17
223 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  has family member  --  ARF16
224 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  has family member  --  ARF11
225 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  has family member  --  ARF10
226 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  has family member  --  ARF2/ARF1-BP
227 ARF3  --  is a member of  --  ARF1 family35, transcription factor gene  --  has family member  --  ARF1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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