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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node LCL1
Type: Protein GRN ID: np40216 Name: LCL1
Annotation: LCL1 | LHY/CCA1-like 1
Gene Locus: AT5G02840
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family MYB-HB-like
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250972_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 LCL1  --  is modified by  --  MPK16
3 LCL1  --  interacts with  --  AT3G54500
4 LCL1  --  interacts with  --  AT5G64170
5 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
6 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CDPK19; CPK8
7 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRL2; MEE3; RSM1
8 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  anac074; NAC074
9 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT4G08170
10 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  PFK3
11 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G38300
12 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPERK9; PERK9
13 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ARF3
14 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AMTK
15 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  KAN; KAN1
16 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G26695
17 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
18 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G35800
19 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G13670
20 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G71450
21 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RGL2
22 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G58730
23 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G02820
24 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  W-BOX
25 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  BUS1; CYP79F1; SPS1
26 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATMKK2; MK1; MKK2
27 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ASL29; LBD27; SCP
28 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G47660
29 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G34450
30 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPP2-A13; PP2-A13
31 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G79020
32 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G20530
33 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  L1L; NF-YB6
34 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB116; MYB116
35 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5
36 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CST; CX32
37 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G25560
38 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  SCL21
39 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  HEC3
40 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  TFIIIA
41 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB18; MYB18
42 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtTLP5; TLP5
43 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL50
44 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtWRKY22; WRKY22
45 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G21590
46 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G45680
47 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  MMZ2; UEV1B
48 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATELF5A-3; ELF5A-3
49 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RVE1
50 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATSUFE; CPSUFE; EMB1374; SUFE1
51 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G19520
52 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATHB-8; ATHB8; HB-8
53 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CYP705A20
54 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AXR5
55 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CRCK2
56 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G06590
57 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G27290
58 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL76
59 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G31390
60 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  DUO1
61 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G05260
62 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G01250
63 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRAB8D; ATRABE1B; RABE1b
64 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CIPK23?
65 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  NF-YA10
66 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G67530
67 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G35460
68 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CKL6; PAPK1
69 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AHP1
70 LCL1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATNIG1; NIG1
71 LCL1  --  interacts with  --  AT3G54500  --  interacts with  --  AtCCA1; CCA1
72 LCL1  --  interacts with  --  AT3G54500  --  interacts with  --  LHY; LHY1
73 LCL1  --  interacts with  --  AT3G54500  --  interacts with  --  LCL5; RVE8
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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