Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATNIG1; NIG1
Type: Protein GRN ID: np39743 Name: ATNIG1; NIG1
Annotation: ATNIG1, NIG1 | NACL-inducible gene 1
Gene Locus: AT5G46830
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family bHLH
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 248867_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16
3 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
4 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CDPK19; CPK8
5 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRL2; MEE3; RSM1
6 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  anac074; NAC074
7 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT4G08170
8 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  PFK3
9 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G38300
10 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPERK9; PERK9
11 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ARF3
12 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AMTK
13 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  KAN; KAN1
14 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G26695
15 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
16 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G35800
17 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G13670
18 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G71450
19 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RGL2
20 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G58730
21 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G02820
22 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  W-BOX
23 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  BUS1; CYP79F1; SPS1
24 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATMKK2; MK1; MKK2
25 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ASL29; LBD27; SCP
26 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G47660
27 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  LCL1
28 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G34450
29 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPP2-A13; PP2-A13
30 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G79020
31 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G20530
32 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  L1L; NF-YB6
33 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB116; MYB116
34 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5
35 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CST; CX32
36 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G25560
37 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  SCL21
38 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  HEC3
39 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  TFIIIA
40 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB18; MYB18
41 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtTLP5; TLP5
42 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL50
43 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtWRKY22; WRKY22
44 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G21590
45 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G45680
46 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  MMZ2; UEV1B
47 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATELF5A-3; ELF5A-3
48 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RVE1
49 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATSUFE; CPSUFE; EMB1374; SUFE1
50 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G19520
51 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATHB-8; ATHB8; HB-8
52 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CYP705A20
53 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AXR5
54 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CRCK2
55 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G06590
56 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G27290
57 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL76
58 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G31390
59 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  DUO1
60 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G05260
61 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G01250
62 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRAB8D; ATRABE1B; RABE1b
63 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CIPK23?
64 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  NF-YA10
65 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G67530
66 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G35460
67 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CKL6; PAPK1
68 ATNIG1; NIG1  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AHP1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact