Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ASL29; LBD27; SCP
Type: Protein GRN ID: np29469 Name: ASL29; LBD27; SCP
Annotation: SCP, LBD27 | LOB domain-containing protein 27
Gene Locus: AT3G47870
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family AS2-LOB
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16
3 ASL29; LBD27; SCP  --  interacts with  --  LBD10
4 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
5 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CDPK19; CPK8
6 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRL2; MEE3; RSM1
7 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  anac074; NAC074
8 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT4G08170
9 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  PFK3
10 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G38300
11 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPERK9; PERK9
12 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ARF3
13 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AMTK
14 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  KAN; KAN1
15 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G26695
16 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
17 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G35800
18 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G13670
19 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G71450
20 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RGL2
21 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G58730
22 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G02820
23 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  W-BOX
24 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  BUS1; CYP79F1; SPS1
25 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATMKK2; MK1; MKK2
26 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT5G47660
27 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  LCL1
28 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G34450
29 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtPP2-A13; PP2-A13
30 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G79020
31 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G20530
32 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  L1L; NF-YB6
33 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB116; MYB116
34 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5
35 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CST; CX32
36 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G25560
37 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  SCL21
38 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  HEC3
39 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  TFIIIA
40 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtMYB18; MYB18
41 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtTLP5; TLP5
42 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL50
43 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AtWRKY22; WRKY22
44 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G21590
45 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G45680
46 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  MMZ2; UEV1B
47 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATELF5A-3; ELF5A-3
48 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  RVE1
49 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATSUFE; CPSUFE; EMB1374; SUFE1
50 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G19520
51 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATHB-8; ATHB8; HB-8
52 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CYP705A20
53 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AXR5
54 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CRCK2
55 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G06590
56 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT3G27290
57 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AGL76
58 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G31390
59 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  DUO1
60 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT2G05260
61 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G01250
62 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATRAB8D; ATRABE1B; RABE1b
63 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CIPK23?
64 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  NF-YA10
65 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G67530
66 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AT1G35460
67 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  CKL6; PAPK1
68 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  AHP1
69 ASL29; LBD27; SCP  --  is modified by  --  MPK16  --  modify  --  ATNIG1; NIG1
70 ASL29; LBD27; SCP  --  interacts with  --  LBD10  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.832194) with  --  AT3G04170
71 ASL29; LBD27; SCP  --  interacts with  --  LBD10  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.900344) with  --  sks10
72 ASL29; LBD27; SCP  --  interacts with  --  LBD10  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813502) with  --  AT5G43800
73 ASL29; LBD27; SCP  --  interacts with  --  LBD10  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.8321) with  --  AT5G54220
74 ASL29; LBD27; SCP  --  interacts with  --  LBD10  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.906787) with  --  AT5G19810
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact