Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node GRF3; RCI1
Type: Protein GRN ID: np39542 Name: GRF3; RCI1
Annotation: GRF3, RCI1 | general regulatory factor 3
Gene Locus: AT5G38480
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 249514_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6
3 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C
4 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS11
5 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS8
6 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS6
7 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5
8 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS2
9 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1
10 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AT5G43330
11 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AT1G04410
12 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  IDH-III
13 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD
14 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TSF
15 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?
16 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AREB3; DPBF3
17 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  A/N-InvG; CINV1
18 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AT2G18876
19 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATWL4; CIPK12; SnRK3.9; WL4
20 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2
21 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G21940
22 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  SKS1
23 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G29020
24 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39360
25 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G29250
26 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G16980
27 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  OCP3
28 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ADF1; atadf; ATADF1
29 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  KAB1; KV-BETA1
30 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
31 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  HMGB5; HMGD; NFD05; NFD5
32 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39050
33 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ORP2A
34 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  APX3
35 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  PIN4
36 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G47530
37 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  SLAC1 CDI3
38 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATF2KP; F2KP; FKFBP
39 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
40 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT-HSFB2A; HSFB2A
41 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G15260
42 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  PAPP2C
43 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  OMTF3
44 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT4G17720
45 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  SS2
46 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC1; VDAC1
47 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC2; VDAC2
48 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ADH; ADH1; ATADH; ATADH1
49 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT-P4H-2
50 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  FIP1
51 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G07340
52 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATHOL3; HOL3
53 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  CHA19; CHR19; ETL1
54 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATRNS1; RNS1
55 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATRAB7B; ATRABG3F; RAB71; RAB7B; RAB7B; RABG3F
56 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G19440
57 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G02750
58 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1a; CRT1; CRT1a
59 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1b; CRT1b
60 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT1G53070
61 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G18240
62 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT2G45820
63 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATGSTF10; ATGSTF4; ERD13; GSTF10
64 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
65 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATERF1
66 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
67 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  CDPK6  --  is a member of  --  ATCDPK3 CPK4 CDPK6 ATCDPK2 CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 cpk21, coding gene
68 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  interacts with  --  AT5G21326
69 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  modify  --  ANAC062; NAC062; NTL6
70 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  modify  --  AT2G27720
71 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  modify  --  EMB3119
72 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  modify  --  AK1
73 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  modify  --  ATGLX1; GLX1
74 GRF3; RCI1  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C  --  modify  --  ABF3
75 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS11  --  has product (in catalytic reaction)  --  MTA
76 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS11  --  has product (in catalytic reaction)  --  MTA
77 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS11  --  has product (in catalytic reaction)  --  ACC
78 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS11  --  is a member of  --  Family76, coding gene
79 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS8  --  is the target gene of  --  ath-miR159c
80 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS8  --  is the target gene of  --  ath-miR159b
81 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS8  --  is the target gene of  --  ath-miR159a
82 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS6  --  interacts with  --  ABI1
83 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS6  --  interacts with  --  14-3-3OMEGA
84 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS6  --  is a member of  --  Family78, coding gene
85 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS6  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.986169) with  --  AT5G59550
86 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  is a member of  --  acs2 bype 2 family, coding gene
87 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  is a member of  --  phosphorylated acs2 bype 2 family, coding gene
88 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  is regulated by  --  ETO family, chromatin remodeling & transcription regulator gene
89 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  is regulated by  --  ATERF11
90 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  interacts with  --  CK1; CKL1
91 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  interacts with  --  ATEOL1; ETO1
92 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  interacts with  --  EOL2
93 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ACS5  --  interacts with  --  EOL1
94 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT1G07795
95 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT1G26850
96 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT1G28695
97 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT2G04080
98 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT2G20970
99 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT2G26110
100 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  ATHPP2C5; PP2C5
101 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  ATGSKB6; GLN1.3; GLN1;3
102 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT3G21310
103 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT3G21690
104 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT3G22430
105 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  GATL10; GolS8
106 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT4G35500
107 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  ATGRP-8; ATGRP18; GRP18
108 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT1G67820
109 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT3G61500
110 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT4G29450
111 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  ATMLO9; MLO9
112 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT1G11230
113 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AtPEPR2; PEPR2
114 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  RGA1
115 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT4G39270
116 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TMKL1  --  interacts with  --  AT5G16920
117 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AT5G43330  --  interacts with  --  GF14 CHI; GRF1
118 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AT1G04410  --  interacts with  --  ATPDI2; ATPDIL1-4; PDI2; PDIL1-4
119 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  regulates the expression of   --  AGL24
120 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  regulates the expression of   --  spl3
121 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  CPK33
122 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  ATCDPK3
123 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  AT5G62040
124 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  ATBZIP27; BZIP27; FDP
125 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  CPK4
126 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  ATC
127 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FD  --  interacts with  --  TFL-1; TFL1
128 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  TSF  --  interacts with  --  ATTCP18; BRC1; TCP18
129 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?  --  regulates the expression of   --  ap1
130 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?  --  is regulated by  --  CO; FG
131 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?  --  is regulated by  --  OBF4
132 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?  --  interacts with  --  AT5G06850
133 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?  --  interacts with  --  AT2G21230
134 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  FT?  --  interacts with  --  ABF4/AREB2
135 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AREB3; DPBF3  --  interacts with  --  ASK1
136 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AREB3; DPBF3  --  interacts with  --  AFP3
137 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AREB3; DPBF3  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
138 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AREB3; DPBF3  --  is modified by  --  SNRK2-3
139 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AREB3; DPBF3  --  is modified by  --  SNRK2-2
140 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  A/N-InvG; CINV1  --  interacts with  --  PIP5K9
141 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  AT2G18876  --  interacts with  --  NAD-ME2
142 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATWL4; CIPK12; SnRK3.9; WL4  --  interacts with  --  ATCBL2; CBL2
143 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATWL4; CIPK12; SnRK3.9; WL4  --  interacts with  --  AT5G27370
144 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  AT5G38640
145 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  AtLOG3
146 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  is regulated by  --  HYH
147 GRF3; RCI1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  is regulated by  --  HY5
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact