Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node SKS1
Type: Protein GRN ID: np32912 Name: SKS1
Annotation: SKS1 | SKU5 similar 1 [TCDB:3.A.5.9]
Gene Locus: AT4G25240
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 254109_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6
3 SKS1  --  interacts with  --  DAD2
4 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G21940
5 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G29020
6 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39360
7 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G29250
8 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G16980
9 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  OCP3
10 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  ADF1; atadf; ATADF1
11 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  KAB1; KV-BETA1
12 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
13 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  HMGB5; HMGD; NFD05; NFD5
14 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39050
15 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  ORP2A
16 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  APX3
17 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  PIN4
18 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G47530
19 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  interacts with  --  SLAC1 CDI3
20 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATF2KP; F2KP; FKFBP
21 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
22 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT-HSFB2A; HSFB2A
23 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G15260
24 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  PAPP2C
25 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  OMTF3
26 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT4G17720
27 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  SS2
28 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC1; VDAC1
29 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC2; VDAC2
30 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ADH; ADH1; ATADH; ATADH1
31 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT-P4H-2
32 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  14-3-3OMEGA
33 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  FIP1
34 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G07340
35 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATHOL3; HOL3
36 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  GF14 UPSILON; GRF5
37 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  CHA19; CHR19; ETL1
38 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATRNS1; RNS1
39 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATRAB7B; ATRABG3F; RAB71; RAB7B; RAB7B; RABG3F
40 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G19440
41 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G02750
42 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  GRF3; RCI1
43 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1a; CRT1; CRT1a
44 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1b; CRT1b
45 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT1G53070
46 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G18240
47 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  AT2G45820
48 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATGSTF10; ATGSTF4; ERD13; GSTF10
49 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
50 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  modify  --  ATERF1
51 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
52 SKS1  --  interacts with  --  CDPK6  --  is a member of  --  ATCDPK3 CPK4 CDPK6 ATCDPK2 CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 cpk21, coding gene
53 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT5G50630
54 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT5G03345
55 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT3G06435
56 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT3G52070
57 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT5G35460
58 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  GPT
59 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  RHA1A
60 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT2G18240
61 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  ATPUP4; PUP4
62 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G14020
63 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT3G28050
64 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G11450
65 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT3G28130
66 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT3G05070
67 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G23300
68 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT2G38510
69 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT4G01410
70 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  CRR23
71 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G11940
72 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT2G23680
73 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  ABCI12
74 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G03660
75 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G05640
76 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  PGPS2
77 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  HOS3-1
78 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT5G55380
79 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT1G47670
80 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AUX1
81 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
82 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  ATCAX11; CAX11
83 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  ATMHX; ATMHX1; MHX; MHX1
84 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  LAG1 HOMOLOG 2; LOH2
85 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
86 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT3G57220
87 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT4G12000
88 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  GONST5
89 SKS1  --  interacts with  --  DAD2  --  interacts with  --  AT2G39530
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact