Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ALF4
Type: Protein GRN ID: np43068 Name: ALF4
Annotation: ALF4 | aberrant lateral root formation 4
Gene Locus: AT5G11030
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245899_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210
3 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
4 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
5 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8
6 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT1G80000
7 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT4G14900
8 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  ELF4-L2
9 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT4G32190
10 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  JAI3
11 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT3G06530
12 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  BEE2
13 ALF4  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT1G60080
14 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT4G33690
15 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  NPL1; PHOT2
16 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G05190
17 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G65683
18 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G19960
19 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G52010
20 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT5G49210
21 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G30860
22 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT2G32840
23 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
24 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT2G39100
25 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G03140
26 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G15200
27 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  PYM; UVI4
28 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  IMPA-2
29 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT4G02720
30 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT3G11590
31 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT1G49850
32 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ATMAP70-2; MAP70-2
33 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  AT2G22680
34 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  OBE1
35 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  interacts with  --  ATMAP70-1; MAP70-1
36 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.862338) with  --  CYP705A8
37 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.840893) with  --  ATMLP-300B; MEE36; MLP-300B
38 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.870371) with  --  AT3G01190
39 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.853208) with  --  ATHB20; HB20
40 ALF4  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.820123) with  --  AT3G59370
41 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATCPK26; CPK26
42 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G39820
43 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G02050
44 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  SIM
45 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G51440
46 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  VPS9B
47 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  EDA40
48 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G10710
49 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G55220
50 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G31875
51 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  HSP18.2
52 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATSAE1B; SAE1B
53 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT-SAE1-2; SAE1B
54 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G13260
55 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATFKBP12; FKBP12
56 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATCYP20-2; CYP20-2
57 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G63200
58 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
59 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  NARA5
60 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G39790
61 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  GrxC5
62 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G58575
63 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  DEP
64 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G12290
65 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G56030
66 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
67 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
68 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATSKL1; SKL1
69 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G38830
70 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATORC4; ORC4
71 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G13520
72 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G30730
73 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G52560
74 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G32160
75 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G54826
76 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  PUB23
77 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G72030
78 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  HINT 2
79 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G34340
80 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G56150
81 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G56680
82 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G15270
83 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G61340
84 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G70590
85 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G12620
86 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  PSBQ; PSBQ-2; PSII-Q
87 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G01820
88 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G03250
89 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G24550
90 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATCAL4; TCH3
91 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G08520
92 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  EMB2819
93 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ARR14
94 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G26460
95 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G24996
96 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  EMB2654
97 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  HAP1; MAGO; MEE63
98 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  CYCA2;3
99 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G06270
100 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G50575
101 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G56290
102 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G19010
103 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  SKL2
104 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  NFD6
105 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G25730
106 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G22270
107 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G56360
108 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AGL27; FLM; MAF1
109 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
110 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G71865
111 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ABCA1; AtABCA1
112 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G42630
113 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  PQL1; PQL2
114 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
115 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G17670
116 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G63470
117 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
118 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATEIF3G1; EIF3G1
119 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G10970
120 ALF4  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G48280
121 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ATU2AF65A
122 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT5G48385
123 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT5G66250
124 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ROXY2
125 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  PPD2; TIFY4B
126 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  NINJA
127 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT1G11810
128 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  INO
129 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
130 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT4G15700
131 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT1G67170
132 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT4G32440
133 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT3G18140
134 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT3G28715
135 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT3G03000
136 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT2G30880
137 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT2G30540
138 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.877438) with  --  AT2G37220
139 ALF4  --  interacts with  --  TIFY8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971779) with  --  EMB2784; RPL4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact