Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G25550
Type: Protein GRN ID: np14966 Name:
Annotation: myb-like transcription factor family protein
Gene Locus: AT1G25550
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family MYB-HB-like
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 255734_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
3 AT1G25550  --  interacts with  --  AT3G54190
4 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2
5 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
6 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111b-5p
7 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111a-5p
8 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  DAR2
9 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  DA1
10 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP3
11 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP5
12 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
13 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
14 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP17
15 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
16 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
17 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G51910
18 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP8
19 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
20 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G35560
21 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  SPY
22 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G14980
23 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G41730
24 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PI
25 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G23770
26 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PYE
27 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AtTHO6; DWA1; THO6
28 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G24900
29 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G36750
30 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
31 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G24860
32 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PLP3b
33 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  CYP705A15
34 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  FSD2
35 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G22720
36 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  MOS1
37 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G30050
38 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G36110
39 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  HSD1
40 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATHSD1; HSD1
41 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G31985
42 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G45010
43 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G66240
44 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G48385
45 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G17180
46 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT3G58510
47 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G38420
48 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  APRR5; PRR5
49 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATPRR1; PRR1
50 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  NZZ; SPL
51 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  SRFR1
52 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  RGA1
53 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
54 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP10
55 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G37000
56 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G49030
57 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G51580
58 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G05710
59 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G22630
60 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G06450
61 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  OHP2
62 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G64460
63 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  CLP2; CLPR2; EMB3146; NCLPP2
64 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G52695
65 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATERF12
66 AT1G25550  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G67800
67 AT1G25550  --  interacts with  --  AT3G54190  --  interacts with  --  AT1G61340
68 AT1G25550  --  interacts with  --  AT3G54190  --  interacts with  --  EMB3003
69 AT1G25550  --  interacts with  --  AT3G54190  --  interacts with  --  AT1G14330
70 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT3G21890
71 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
72 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATWRKY6; WRKY6
73 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  OBF5
74 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G50680
75 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  GATA16
76 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
77 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA3
78 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ZFP4
79 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RVE1
80 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATZFP10; ZFP10
81 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AGL15
82 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT2G33550
83 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G68670
84 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA13
85 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATMYB73; MYB73
86 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  SOC1
87 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATMYB3R2; MYB3R-2; MYB3R2; PC-MYB2
88 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G51120
89 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT-HSFB2B; HSFB2B
90 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA19
91 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AP2; FL1; FLO2
92 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  SPL1
93 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RAV1
94 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  bZIP23
95 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATBZIP9; BZIP9; BZO2H2
96 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AS1
97 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA11
98 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AXR5
99 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  TOE2
100 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ARF17
101 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA2
102 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA10
103 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
104 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  CHR4; PKR1
105 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA8
106 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATMYB7; ATY49; MYB7
107 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT-HSFB1; ATHSF4; HSF4; HSFB1
108 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G25560
109 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  EPR1; RVE7
110 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ASL39; LBD37
111 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  LBD41
112 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
113 AT1G25550  --  interacts with  --  TPR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.846075) with  --  GTE4
114 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ABI5
115 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ABF3
116 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ABF1
117 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
118 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AHG1
119 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  CPK24
120 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATDI19; DI19
121 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G41670
122 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G27850
123 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G27760
124 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  IQD24
125 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATCPL1; CPL1; FRY2
126 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  NAGS1
127 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT2G32750
128 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  PIN7
129 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AtHB32; HB32; ZHD14
130 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT3G22530
131 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  PSB29; THF1
132 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  mtACP2
133 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATTOC33; PPI1; TOC33
134 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ADF3
135 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  UCH2
136 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT1G74470
137 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  HSP1
138 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATBT2; BT2
139 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G52550
140 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT3G26510
141 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23
142 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATWRKY8; WRKY8
143 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATRBOH D
144 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATRBOH F
145 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATWRKY28; WRKY28
146 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ABF4/AREB2
147 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ABF2/AREB1
148 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATWRKY48; WRKY48
149 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
150 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  transport  --  Sterol
151 AT1G25550  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  is a member of  --  ATCDPK3 CPK4 CDPK6 ATCDPK2 CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 cpk21, coding gene
152 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111b-5p  --  inhibit the expression of  --  AT5G52010
153 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111b-5p  --  inhibit the expression of  --  AT5G45060
154 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111b-5p  --  inhibit the expression of  --  AT3G27150
155 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111b-5p  --  inhibit the expression of  --  ACO1
156 AT1G25550  --  is the target gene of  --  ath-miR2111b-5p  --  inhibit the expression of  --  AT1G07010
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact