Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node LBD41
Type: Protein GRN ID: np28085 Name: LBD41
Annotation: LBD41 | LOB domain-containing protein 41
Gene Locus: AT3G02550
Transcription factor /
transcriptional regulator:
transcription factor family AS2-LOB
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 258487_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
3 LBD41  --  interacts with  --  TPR3
4 LBD41  --  interacts with  --  TPR2
5 LBD41  --  interacts with  --  TPR1
6 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AtMYB98; MYB98
7 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT3G21890
8 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TCP8
9 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G51120
10 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT-HSFB2B; HSFB2B
11 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA19
12 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AP2; FL1; FLO2
13 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  SPL1
14 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  RAV1
15 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  bZIP23
16 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ATBZIP9; BZIP9; BZO2H2
17 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TOE2
18 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF17
19 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA2
20 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA10
21 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
22 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT5G42530
23 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF18
24 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF9
25 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF2/ARF1-BP
26 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  JAZ6
27 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G30810
28 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  FRS3
29 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ATZFP11; ZFP11
30 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  STZ; ZAT10
31 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT-HSFB1; ATHSF4; HSF4; HSFB1
32 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G25560
33 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  EPR1; RVE7
34 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ASL39; LBD37
35 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  NZZ; SPL
36 LBD41  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  transport  --  Sterol
37 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G63350
38 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BBM
39 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G16350
40 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR2
41 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATWRKY30; WRKY30
42 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB15; ATY19; MYB15
43 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB20; MYB20
44 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYBL2; MYBL2
45 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BZIP45
46 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB97; MYB97
47 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G35560
48 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP16
49 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ANAC055; ATNAC3; NAC055; NAC3
50 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G38300
51 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF12
52 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  HAT1
53 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT4G35610
54 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP3
55 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  anac074; NAC074
56 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G33550
57 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G68670
58 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA13
59 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB73; MYB73
60 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  SOC1
61 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
62 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB3R2; MYB3R-2; MYB3R2; PC-MYB2
63 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA11
64 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR5
65 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G14970
66 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARI1; ATARI1
67 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G44630
68 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  EMF1
69 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BEH4
70 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATTKL; TKL
71 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G55040
72 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR3
73 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  JAZ5
74 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB44
75 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB32; MYB32
76 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB7; ATY49; MYB7
77 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-8
78 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-7
79 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-4
80 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF3
81 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
82 LBD41  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA3
83 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G25550
84 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
85 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATWRKY6; WRKY6
86 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  OBF5
87 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G50680
88 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  GATA16
89 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
90 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ZFP4
91 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RVE1
92 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATZFP10; ZFP10
93 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AGL15
94 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AS1
95 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  CHR4; PKR1
96 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA8
97 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
98 LBD41  --  interacts with  --  TPR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.846075) with  --  GTE4
99 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATWRKY32; WRKY32
100 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  GATA9
101 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  CBF4; DREB1D
102 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  bZIP21; TGA9
103 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  NF-YC4
104 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT4G03250
105 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT3G12730
106 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATWRKY61; WRKY61
107 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  anac096; NAC096
108 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G80610
109 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G12120
110 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT4G32030
111 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATSUMO3; SUM3; SUMO 3; SUMO3
112 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
113 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT2G36080
114 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  IAA18
115 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  GATA18; HAN; MNP
116 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  MYB77
117 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATERF11
118 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  is regulated by  --  JAI3
119 LBD41  --  interacts with  --  TPR1  --  is the target gene of  --  ath-miR5024-3p
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab