Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATYSL3; YSL3
Type: Protein GRN ID: np39154 Name: ATYSL3; YSL3
Annotation: YSL3, ATYSL3 | YELLOW STRIPE like 3 [TCDB:2.A.21.6] [TCDB:2.A.21.9]
Gene Locus: AT5G53550
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 248276_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  RPK1
3 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATVTI11; ATVTI1A; SGR4; VTI11; VTI1A; ZIG; ZIG1
4 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760
5 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATMLO11; MLO11
6 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8
7 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2
8 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ERD6
9 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1
10 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATGLR2.9; GLR2.9; GLR2.9
11 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine
12 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Nitrogen
13 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline
14 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea
15 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  RPK1  --  interacts with  --  ATCNGC13; CNGC13
16 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  RPK1  --  is the target gene of  --  ath-miR833a-3p
17 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATVTI11; ATVTI1A; SGR4; VTI11; VTI1A; ZIG; ZIG1  --  interacts with  --  AT4G26450
18 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATVTI11; ATVTI1A; SGR4; VTI11; VTI1A; ZIG; ZIG1  --  interacts with  --  AT5G11710
19 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  AT5G35460
20 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  AT1G76185
21 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  ARGOS
22 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
23 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  CAT9
24 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  ATERDJ2A
25 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  ATCAT6; CAT6
26 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  AT2G25520
27 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AT1G66760  --  interacts with  --  AT1G73920
28 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATMLO11; MLO11  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2
29 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  interacts with  --  ATCNGC17; CNGC17
30 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  interacts with  --  ATPUP3; PUP3
31 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  interacts with  --  AT1G19450
32 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  interacts with  --  ATPTR2; ATPTR2-B; NTR1; PTR2; PTR2-B
33 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  interacts with  --  GLT1; PGLCT
34 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  interacts with  --  ATUPS1; UPS1
35 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831478) with  --  AT2G02515
36 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.921357) with  --  PAB3
37 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.922102) with  --  AT2G16410
38 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.837311) with  --  RPP27
39 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.844384) with  --  AT3G10750
40 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.849936) with  --  AT3G27590
41 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.838744) with  --  AT3G30250
42 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.844395) with  --  AT3G21410
43 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814589) with  --  ACHT3
44 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813962) with  --  AT4G12150
45 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813962) with  --  AT4G12140
46 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.985118) with  --  AtPP2-B12; PP2-B12
47 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.872199) with  --  AT5G24480
48 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.8097) with  --  AT5G53635
49 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AAP8; ATAAP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.812977) with  --  AT5G09370
50 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ATCNGC18; CNGC18
51 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ABCG10
52 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ATMND1
53 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  TCP10
54 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR10
55 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR2
56 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR1
57 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR9
58 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AT5G03200
59 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CKI1
60 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AHK5; CKI2; HK5
61 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF7
62 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF8
63 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF6
64 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF5
65 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF4
66 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF1
67 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CKI1; CKL11
68 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ETR1
69 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR14
70 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR7
71 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR5
72 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR3
73 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AHK4
74 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AHK2
75 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR22
76 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  is a member of  --  AHP1 family68, coding gene
77 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AHP2  --  is a member of  --  AHP1 family66, coding gene
78 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  CIPK23?
79 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  ATSOS3; CBL4; SOS3
80 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  ATCBL1
81 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  CBL9
82 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  CBL5
83 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  CBL7
84 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  ATCBL10; CBL10; SCABP8
85 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  CRK10; RLK4
86 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  KAT1
87 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  AKT2
88 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  SNRK2-3 family52, coding gene
89 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
90 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  CIPK16; SnRK3.18
91 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  ATCIPK6; CIPK6; SIP3; SNRK3.14
92 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  interacts with  --  ATKC1; AtLKT1; KAT3; KC1
93 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  AKT1  --  is the target gene of  --  ath-miR852
94 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATGLR2.9; GLR2.9; GLR2.9  --  interacts with  --  ERS2
95 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATGLR2.9; GLR2.9; GLR2.9  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4
96 ATYSL3; YSL3  --  interacts with  --  ATGLR2.9; GLR2.9; GLR2.9  --  interacts with  --  ATCPK1; CPK1
97 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
98 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
99 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD7
100 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
101 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD6
102 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2
103 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1
104 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT2G18193
105 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT1G80400
106 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30
107 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT1G51350
108 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT1G09440
109 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  AT5G54620
110 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ANK
111 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATCNGC4; CNGC4; DND2; HLM1
112 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATVDAC5; VDAC5
113 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Prolyl-tRNA(Pro)
114 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  (S)-1-Pyrroline-5-carboxylate
115 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  COB
116 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  APE2; TPT
117 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPTR3; PTR3
118 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G46040
119 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45450
120 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATDUR3; DUR3
121 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45370
122 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ZIP8
123 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  HMA7; RAN1
124 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT4;6
125 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ALA2
126 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI21; ATNAP2; ATPOP1; POP1
127 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G44050
128 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSUC6; SUC6
129 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
130 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
131 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
132 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G42420
133 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G42210
134 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
135 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G41800
136 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G41760
137 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
138 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
139 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  YSL4
140 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
141 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  LHT1
142 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G40670
143 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G40240
144 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G33220
145 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G02400
146 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  MDAR6
147 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
148 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  GONST5
149 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G21070
150 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
151 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
152 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G14820
153 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08900
154 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Arginine
155 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08870
156 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCA4; ATATH3
157 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCA3; ATATH2; ATH2
158 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCA2; ATATH1; ATH1
159 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  TIP5;1
160 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  PHT4;3
161 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATUTR5; UTR5
162 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1
163 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G45720
164 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G45710
165 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G45700
166 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G45690
167 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G45680
168 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G45660
169 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  NAXT1
170 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATNRT2.6; NRT2.6
171 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATCHX10; CHX10
172 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATCHX11; CHX11
173 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATCHX12; CHX12
174 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATCHX4; CHX4
175 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ZIFL2
176 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AHA8; HA8
177 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G30390
178 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G30340
179 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G28960
180 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCB19/ATMDR1
181 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCB22
182 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCB18; PGP18
183 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCB17; PGP17
184 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCB16; PGP16
185 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCB15; MDR13
186 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G28130
187 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G28100
188 ATYSL3; YSL3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT3G28080
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact