Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATVDAC5; VDAC5
Type: Protein GRN ID: np26079 Name: ATVDAC5; VDAC5
Annotation: VDAC5, ATVDAC5 | voltage dependent anion channel 5 [TCDB:2.A.21.9] [TCDB:9.B.27.1]
Gene Locus: AT3G49920
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 252228_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  Nitrogen
3 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline
4 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  AT5G54620
5 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ANK
6 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATCNGC4; CNGC4; DND2; HLM1
7 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
8 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Prolyl-tRNA(Pro)
9 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  (S)-1-Pyrroline-5-carboxylate
10 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
11 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
12 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD7
13 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD6
14 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  COB
15 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  APE2; TPT
16 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPTR3; PTR3
17 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G46040
18 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45450
19 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATDUR3; DUR3
20 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45370
21 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ZIP8
22 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  HMA7; RAN1
23 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT4;6
24 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ALA2
25 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI21; ATNAP2; ATPOP1; POP1
26 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G44050
27 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSUC6; SUC6
28 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
29 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
30 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
31 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G42420
32 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G42210
33 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
34 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G41800
35 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G41760
36 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
37 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
38 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  YSL4
39 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
40 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  LHT1
41 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G40670
42 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G40240
43 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G33220
44 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G02400
45 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  MDAR6
46 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
47 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  GONST5
48 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G21070
49 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
50 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
51 ATVDAC5; VDAC5  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G14820
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact