Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ABCA4; ATATH3
Type: Protein GRN ID: np27382 Name: ABCA4; ATATH3
Annotation: ATATH3, ABCA4 | ATP binding cassette subfamily A4 [TCDB:1.A.8.10] [TCDB:1.A.8.12] [TCDB:1.A.8.8]
Gene Locus: AT3G47750
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 252381_s_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid
3 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Arsenite
4 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Silicon
5 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite
6 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol
7 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea
8 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA5; ATATH4; ATH4
9 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA3; ATATH2; ATH2
10 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA2; ATATH1; ATH1
11 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  TIP5;1
12 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ATPS3; PS3
13 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  PHT4;3
14 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ATUTR5; UTR5
15 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G30390
16 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G28960
17 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCB19/ATMDR1
18 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCB17; PGP17
19 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G28080
20 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  PHT3;1
21 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ZIFL1
22 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ZIF1
23 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT5G13670
24 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ABCG6
25 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  SULTR4;1
26 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  KEG
27 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AAC2
28 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT4G01440
29 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  EDA13; EDA19; SWA1
30 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G46520
31 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G44920
32 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  TPR15
33 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ER; QRP1
34 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G23780
35 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G21120
36 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  has product (in catalytic reaction)  --  sn-Glycerol 3-phosphate
37 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1
38 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45720
39 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45710
40 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45700
41 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45690
42 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45680
43 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45660
44 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  NAXT1
45 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATNRT2.6; NRT2.6
46 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX10; CHX10
47 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX11; CHX11
48 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX12; CHX12
49 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX4; CHX4
50 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ZIFL2
51 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AHA8; HA8
52 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G30340
53 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ABCB22
54 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ABCB18; PGP18
55 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ABCB16; PGP16
56 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ABCB15; MDR13
57 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G28130
58 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G28100
59 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  SCM; SRF9; SUB
60 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08900
61 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Arginine
62 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08870
63 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
64 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  GONST5
65 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT1G21070
66 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
67 ABCA4; ATATH3  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab