Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AtSDF2; ATSDL; SDF2
Type: Protein GRN ID: np19402 Name: AtSDF2; ATSDL; SDF2
Annotation: SDF2, ATSDL, AtSDF2 | stromal cell-derived factor 2-like protein precursor [TCDB:3.A.1.11]
Gene Locus: AT2G25110
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 264382_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Mannopine
3 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine
4 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  2-Aminoethylphosphonate
5 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate
6 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine
7 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine
8 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Mannopine  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1
9 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Mannopine  --  is transported by  --  AT2G18193
10 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
11 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
12 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD7
13 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
14 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  NAD6
15 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
16 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT1G80400
17 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30
18 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT1G51350
19 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Polyamine  --  is transported by  --  AT1G09440
20 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Succinate semialdehyde
21 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1
22 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD5
23 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD4
24 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD3
25 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p
26 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-5p
27 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD2
28 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1
29 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
30 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
31 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L
32 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ZIP8
33 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
34 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
35 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
36 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420
37 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42210
38 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
39 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800
40 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41760
41 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
42 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
43 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  YSL4
44 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
45 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1
46 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40670
47 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40240
48 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420
49 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G03550
50 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-Acetamidopropanal
51 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-Aminopropanal
52 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  has product (in catalytic reaction)  --  4-Aminobutyraldehyde
53 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  has product (in catalytic reaction)  --  1,3-Diaminopropane
54 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSPDS3; SPDS3; SPMS
55 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  S-Adenosylmethioninamine
56 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ACL5
57 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SPDS2
58 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SPDS1
59 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPAO3; PAO3
60 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  N1-Acetylspermidine
61 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  N1-Acetylspermine
62 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Spermine
63 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPAO2; PAO2
64 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPAO4; PAO4
65 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  APAO; ATPAO1; PAO1
66 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPAO5; PAO5
67 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine  --  has product (in catalytic reaction)  --  MTA
68 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine  --  has product (in catalytic reaction)  --  MTA
69 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATNLP1; CPA; NLP1
70 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  N-Carbamoylputrescine
71 AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine  --  is transported by  --  NAD4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact