Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node YSL4
Type: Protein GRN ID: np38374 Name: YSL4
Annotation: YSL4 | YELLOW STRIPE like 4 [TCDB:2.A.18.2] [TCDB:2.A.18.3] [TCDB:2.A.18.4]
Gene Locus: AT5G41000
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 249334_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate
3 YSL4  --  transport  --  L-Proline
4 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Succinate semialdehyde
5 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1
6 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD5
7 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD4
8 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD3
9 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p
10 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-5p
11 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD2
12 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1
13 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
14 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
15 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L
16 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
17 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6
18 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ZIP8
19 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
20 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
21 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
22 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420
23 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42210
24 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
25 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800
26 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41760
27 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
28 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
29 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
30 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1
31 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40670
32 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40240
33 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2
34 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1
35 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT2G18193
36 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G80400
37 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30
38 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G51350
39 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G09440
40 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420
41 YSL4  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G03550
42 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Prolyl-tRNA(Pro)
43 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  (S)-1-Pyrroline-5-carboxylate
44 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
45 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
46 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD7
47 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  COB
48 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G54620
49 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ANK
50 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCNGC4; CNGC4; DND2; HLM1
51 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
52 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  APE2; TPT
53 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPTR3; PTR3
54 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G46040
55 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45450
56 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATDUR3; DUR3
57 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45370
58 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  HMA7; RAN1
59 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT4;6
60 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ALA2
61 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI21; ATNAP2; ATPOP1; POP1
62 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G44050
63 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSUC6; SUC6
64 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATVDAC5; VDAC5
65 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G33220
66 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G02400
67 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  MDAR6
68 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
69 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  GONST5
70 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G21070
71 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
72 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
73 YSL4  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G14820
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact