Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G03200
Type: Protein GRN ID: np37882 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein
Gene Locus: AT5G03200
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250931_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G03200  --  interacts with  --  MED32
3 AT5G03200  --  interacts with  --  AT3G56820
4 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330
5 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2
6 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B
7 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU6; GDU6
8 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2
9 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU5; GDU5
10 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4
11 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU3; GDU3; LSB1
12 AT5G03200  --  interacts with  --  GDU1
13 AT5G03200  --  interacts with  --  MED32  --  interacts with  --  AT3G27420
14 AT5G03200  --  interacts with  --  MED32  --  interacts with  --  AT4G20150
15 AT5G03200  --  interacts with  --  AT3G56820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.816546) with  --  ARPC5; CRK
16 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  ATYLMG2; YLMG2
17 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT4; ATIPS2
18 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT3G52070
19 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT2G16030
20 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  ARK3; RK3
21 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT5G56100
22 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT1G14020
23 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT1G63110
24 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT2G43420
25 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT4G37445
26 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  ARGOS
27 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2
28 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AGP27; ATAGP27
29 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AT4G26770
30 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  ATNRAMP2; NRAMP2
31 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  ATPLC2; PLC2
32 AT5G03200  --  interacts with  --  AT5G55330  --  interacts with  --  AMT1;1; ATAMT1; ATAMT1;1
33 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ATCNGC18; CNGC18
34 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ABCG10
35 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ATYSL3; YSL3
36 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ATMND1
37 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  TCP10
38 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR10
39 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR2
40 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR1
41 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR9
42 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CKI1
43 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AHK5; CKI2; HK5
44 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF7
45 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF8
46 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF6
47 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF5
48 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF4
49 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CRF1
50 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  CKI1; CKL11
51 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ETR1
52 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR14
53 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR7
54 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR5
55 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR3
56 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AHK4
57 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  AHK2
58 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  interacts with  --  ARR22
59 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  is a member of  --  AHP1 family68, coding gene
60 AT5G03200  --  interacts with  --  AHP2  --  is a member of  --  AHP1 family66, coding gene
61 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  interacts with  --  CHAL; EPFL6
62 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  interacts with  --  ATCHX9; CHX9
63 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
64 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  interacts with  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
65 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  interacts with  --  PIP1;4; PIP1E; TMP-C
66 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  interacts with  --  AT5G61630
67 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.826689) with  --  ATMYB59; ATMYB59-1; ATMYB59-2; ATMYB59-3; MYB59
68 AT5G03200  --  interacts with  --  PIP2;2; PIP2B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813574) with  --  AT5G61340
69 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT5G19080
70 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT3G53410
71 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATCAT6; CAT6
72 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATPTR2; ATPTR2-B; NTR1; PTR2; PTR2-B
73 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT2G41190
74 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  GF14 IOTA; GRF12
75 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ERS2
76 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATGLR1.3; GLR1.3
77 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  LAC11
78 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  TMT2
79 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATSTP1; STP1
80 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATIREG1; FPN1; IREG1
81 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ACA3; ATECA1; ECA1
82 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATGSTF2; ATPM24; ATPM24.1; GST2; GSTF2
83 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT5G65990
84 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AAP4
85 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATMLO11; MLO11
86 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT3G05400
87 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT4G22790
88 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATCBL1
89 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATCNGC20; CNBT1; CNGC20
90 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AMT1;4
91 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT5G33280
92 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  PHT4;3
93 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATVAMP711; VAMP711
94 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
95 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ANT1
96 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATMLO13; MLO13
97 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ATFRD3; FRD3; MAN1
98 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
99 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ABCG12; AtABCG12; ATWBC12; CER5; D3; WBC12
100 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ERD6
101 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  KEU
102 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  AT4G18205
103 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2  --  interacts with  --  ACAM-2; CAM5
104 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU5; GDU5  --  interacts with  --  AT2G22180
105 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATCPK1; CPK1
106 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ALF5
107 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATCCH1; ATTPC1; FOU2; TPC1; TPC1
108 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  AT2G38510
109 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  NIP7;1; NLM6; NLM8
110 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATSUC4; ATSUT4; SUC4; SUT4
111 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATSUC7; SUC7
112 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ZF14; ZRZ
113 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATGLR2.9; GLR2.9; GLR2.9
114 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATSTP4; STP4
115 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  AT3G30390
116 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  AT1G31820
117 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATCLC-B; CLC-B
118 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ATSOS2; CIPK24; SNRK3.11; SOS2
119 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  TMK1
120 AT5G03200  --  interacts with  --  AtGDU4; GDU4  --  interacts with  --  ACA2
121 AT5G03200  --  interacts with  --  ATGDU3; GDU3; LSB1  --  interacts with  --  CYP71B22
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact