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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G54620
Type: Protein GRN ID: np38013 Name:
Annotation: Ankyrin repeat family protein [TCDB:2.A.21.9]
Gene Locus: AT5G54620
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 248170_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G54620  --  transport  --  Nitrogen
3 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline
4 AT5G54620  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ANK
5 AT5G54620  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATCNGC4; CNGC4; DND2; HLM1
6 AT5G54620  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
7 AT5G54620  --  transport  --  Nitrogen  --  is transported by  --  ATVDAC5; VDAC5
8 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Prolyl-tRNA(Pro)
9 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  has product (in catalytic reaction)  --  (S)-1-Pyrroline-5-carboxylate
10 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
11 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
12 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD7
13 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  NAD6
14 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  COB
15 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  APE2; TPT
16 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPTR3; PTR3
17 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G46040
18 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45450
19 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATDUR3; DUR3
20 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G45370
21 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ZIP8
22 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  HMA7; RAN1
23 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT4;6
24 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ALA2
25 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI21; ATNAP2; ATPOP1; POP1
26 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G44050
27 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSUC6; SUC6
28 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
29 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
30 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
31 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G42420
32 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G42210
33 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
34 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G41800
35 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G41760
36 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
37 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
38 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  YSL4
39 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
40 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  LHT1
41 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G40670
42 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT5G40240
43 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G33220
44 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT2G02400
45 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  MDAR6
46 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
47 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  GONST5
48 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G21070
49 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
50 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
51 AT5G54620  --  transport  --  L-Proline  --  is transported by  --  AT1G14820
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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