Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G25490
Type: Protein GRN ID: np38442 Name:
Annotation: Ran BP2/NZF zinc finger-like superfamily protein
Gene Locus: AT5G25490
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 246891_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1
3 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
4 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30
5 AT5G25490  --  interacts with  --  AtRZ-1c; RZ-1c
6 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220
7 AT5G25490  --  interacts with  --  AT4G24500
8 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370
9 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
10 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  pil5
11 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  PIF6; PIL2
12 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  PIL1
13 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  PIF3
14 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
15 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2
16 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
17 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  APRR9; PRR9; TL1
18 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  PIF5; PIL6
19 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  PIF4
20 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
21 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AT5G05190
22 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
23 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AT2G33410
24 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AT1G20880
25 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AT3G06790
26 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AT1G67170
27 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  AT1G33470
28 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  APRR5; PRR5
29 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  ABI3
30 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  interacts with  --  APRR3; PRR3
31 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  is regulated by  --  RVE1
32 AT5G25490  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1  --  is regulated by  --  LHY; LHY1
33 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP8
34 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
35 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
36 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G35560
37 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G51910
38 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP3
39 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
40 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
41 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP5
42 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
43 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP17
44 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G42470
45 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G15700
46 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G55690
47 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATHB-2; ATHB2; HAT4; HB-2
48 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G61920
49 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NDF4
50 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G47310
51 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G22355
52 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G23770
53 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  BBX32; EIP6
54 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32295
55 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  FSD2
56 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G50180
57 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HCF136
58 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G11550
59 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G63350
60 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G10710
61 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TOE2
62 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ACX1
63 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32190
64 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G38430
65 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HDG4
66 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G10970
67 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G35250
68 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CDKC;1
69 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G13440
70 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATSEN1; DIN1; SEN1; SEN1
71 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G01920
72 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASE2; ATASE2; ATPURF2; CIA1
73 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MARD1
74 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATAIG1; BHLH32; TMO5
75 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATGRXCP; CXIP1
76 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G15640
77 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
78 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATVAMP714; VAMP714; VAMP714
79 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
80 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  VPS9B
81 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G17486
82 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AO
83 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ROXY2
84 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G09250
85 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NZZ; SPL
86 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CHR3; SYD
87 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G37000
88 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP10
89 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
90 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
91 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G05710
92 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G32160
93 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ZFP7
94 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G06450
95 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATMKK9
96 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
97 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G11800
98 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NTRC
99 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  KDSB
100 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  APL; WDY
101 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G38000
102 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PDH-E1 BETA
103 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ANAC041; NAC041
104 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G09660
105 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G12810
106 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PSAD-2
107 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SKL2
108 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G03500
109 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G21860
110 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SMU1
111 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G45850
112 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TAF15
113 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G25730
114 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G24860
115 AT5G25490  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G17970
116 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  ATU2AF35B; U2AF35B
117 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  AME3
118 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  AT-RS2Z33; ATRSZ33; RS2Z33; RSZ33
119 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-SCL30A; SCL30A
120 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-SCL28; SCL28
121 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-SR34; ATSRP34; SR1; SR34; SRP34
122 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-SR30; ATSRP30; ATSRP30.1; ATSRP30.2; SR30
123 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-RSZ21; RSZ21; RSZP21; SRZ-21; SRZ21
124 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  AT1G71020
125 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  AtRZ-1b; RZ-1b
126 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-RSZ22; RSZ22; RSZP22; SRZ-22; SRZ22
127 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  AT3G63400
128 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  AT4G32420
129 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-SC35; ATSC35; SC35
130 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  At-SCL33; ATSCL33; SCL33; SR33
131 AT5G25490  --  interacts with  --  At-SCL30; SCL30  --  interacts with  --  ATCYP59; CYP59
132 AT5G25490  --  interacts with  --  AtRZ-1c; RZ-1c  --  interacts with  --  AT5G53060
133 AT5G25490  --  interacts with  --  AtRZ-1c; RZ-1c  --  interacts with  --  AT5G06770
134 AT5G25490  --  interacts with  --  AtRZ-1c; RZ-1c  --  interacts with  --  AT2G44710
135 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  interacts with  --  ATCSP3; CSP3
136 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  transport  --  Ferrichrome
137 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  transport  --  Fe(III)hydroxamate
138 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  transport  --  Aerobactin
139 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  transport  --  Taurine
140 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.26507) with  --  ATCPO-I; HEMF1; LIN2
141 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.81546) with  --  AT1G09130
142 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.23335) with  --  emb2394
143 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.15526) with  --  AT1G22700
144 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.21837) with  --  RPS9; TWN3
145 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.23447) with  --  AT1G64510
146 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17947) with  --  EMB2784; RPL4
147 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.21209) with  --  AT1G29070
148 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17876) with  --  CS17; PDE347; PRPS17; RPS17
149 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.07688) with  --  AT3G05410
150 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.879538) with  --  AT3G32930
151 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.858127) with  --  AT4G00030
152 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.877438) with  --  TIFY8
153 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.11642) with  --  CP29
154 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.15045) with  --  AtcpRRF; cpRRF; HFP108; RRF
155 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G37220  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.940009) with  --  AT3G63160
156 AT5G25490  --  interacts with  --  AT4G24500  --  interacts with  --  CDKC2; CDKC;2
157 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  LSU2
158 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT4G39050
159 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  LSU1
160 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT5G19960
161 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT5G58720
162 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  BOI; RING
163 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT3G50910
164 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  SUA
165 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT3G11590
166 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT5G38600
167 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT5G53800
168 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2
169 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  At-RS40; AT-SRP40; ATRSP35; ATRSP40; RS40; RSP35
170 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  At-RS31; ATRSP31; RS31; RSP31
171 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  AT1G30860
172 AT5G25490  --  interacts with  --  AT2G43370  --  interacts with  --  At-RSZ22a; RSZ22a
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact