Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node CDKC;1
Type: Protein GRN ID: np38368 Name: CDKC;1
Annotation: CDKC;1 | cyclin-dependent kinase C;1
Gene Locus: AT5G10270
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250451_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 CDKC;1  --  modify  --  MED22B
3 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2
4 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
5 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440
6 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3
7 CDKC;1  --  modify  --  MED22B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813805) with  --  AT1G76120
8 CDKC;1  --  modify  --  MED22B  --  is modified by  --  CDKC2; CDKC;2
9 CDKC;1  --  modify  --  MED22B  --  is modified by  --  CAK1AT; CDKF;1
10 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  PLP3b
11 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  CHR3; SYD
12 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  RFI2
13 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  HB-3; STIP; WOX9; WOX9A
14 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AT4G17680
15 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5
16 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  ATERF12
17 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AT3G28715
18 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
19 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
20 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  ZFP7
21 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AO
22 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
23 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
24 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  LSU1
25 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AT3G48550
26 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
27 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AT3G09250
28 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AT2G37150
29 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  BRX
30 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  AT3G13990
31 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
32 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  TPR2
33 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  TPR1
34 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  interacts with  --  TPR3
35 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  is the target gene of  --  ath-miR172e
36 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  is the target gene of  --  ath-miR172d
37 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  is the target gene of  --  ath-miR172c
38 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  is the target gene of  --  ath-miR172b-3p
39 CDKC;1  --  interacts with  --  TOE2  --  is the target gene of  --  ath-miR172a
40 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP8
41 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
42 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
43 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G35560
44 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G51910
45 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP3
46 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
47 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
48 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP5
49 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
50 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP17
51 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G42470
52 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
53 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G15700
54 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G55690
55 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATHB-2; ATHB2; HAT4; HB-2
56 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G05190
57 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G61920
58 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NDF4
59 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G47310
60 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G22355
61 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G23770
62 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G25490
63 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  BBX32; EIP6
64 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32295
65 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  FSD2
66 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G50180
67 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HCF136
68 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G11550
69 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G63350
70 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G10710
71 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ACX1
72 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32190
73 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G38430
74 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HDG4
75 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G10970
76 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G35250
77 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G13440
78 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATSEN1; DIN1; SEN1; SEN1
79 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G01920
80 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASE2; ATASE2; ATPURF2; CIA1
81 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MARD1
82 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATAIG1; BHLH32; TMO5
83 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATGRXCP; CXIP1
84 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G15640
85 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
86 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATVAMP714; VAMP714; VAMP714
87 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
88 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  VPS9B
89 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G17486
90 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ROXY2
91 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NZZ; SPL
92 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G37000
93 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP10
94 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
95 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
96 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATRBP45B; RBP45B
97 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G05710
98 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G32160
99 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G06450
100 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATMKK9
101 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G11800
102 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NTRC
103 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  KDSB
104 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  APL; WDY
105 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G38000
106 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PDH-E1 BETA
107 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ANAC041; NAC041
108 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G09660
109 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G12810
110 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PSAD-2
111 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SKL2
112 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G03500
113 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G21860
114 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SMU1
115 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G45850
116 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TAF15
117 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G25730
118 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G24860
119 CDKC;1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G17970
120 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  KAN; KAN1
121 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT1G31050
122 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT4G01090
123 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT5G38640
124 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT2G45360
125 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT4G21705
126 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G56680
127 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G22440
128 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT5G38420
129 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT5G48385
130 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G51180
131 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G61790
132 CDKC;1  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT1G49850
133 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  RGA1
134 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  FRS3
135 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  AFO; FIL; YAB1
136 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  is regulated by  --  ATMYC2
137 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AIB; ATAIB
138 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G01260
139 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  JAZ9
140 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  JAZ4
141 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AHL20
142 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
143 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT-EXPR; ATEXLB1; ATEXPR1; ATHEXP BETA 3.1; EXLB1; EXPR
144 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G59210
145 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G60340
146 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  MYC3
147 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  MYC4
148 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  COI1
149 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
150 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G14240
151 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
152 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G15130
153 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G52695
154 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G67170
155 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ACR6
156 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G18660
157 CDKC;1  --  interacts with  --  JAI3  --  is a member of  --  JAI3 family107, transcription factor gene
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact