Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G42470
Type: Protein GRN ID: np37242 Name:
Annotation: CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Brain/reproductive organ-expressed protein (InterPro:IPR010358); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT5G42470
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 249192_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1
3 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
4 AT5G42470  --  interacts with  --  AT4G32960
5 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  BAK1
6 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  ATSERK1
7 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  ATSYP22; ATVAM3; SGR3; SYP22; VAM3
8 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  ATVAMP727; VAMP727; VAMP727
9 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  BIK1
10 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT1G50990
11 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT5G41260
12 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT5G59010
13 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT3G54030
14 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  bsk3
15 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  bsk1
16 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  TTL
17 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1
18 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT1G18470
19 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  BKI1
20 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  ACAM-6; CAM6
21 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  bsk2
22 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  ATSERK2; SERK2
23 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  AT5G02800
24 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  CDG1
25 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  is modified by  --  BIR1
26 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  transport  --  Phospholipid
27 AT5G42470  --  is modified by  --  BRI1/BIN1  --  is a member of  --  BRI1+BIN1 family3, coding gene
28 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP8
29 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
30 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
31 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
32 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G35560
33 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G51910
34 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP3
35 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
36 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
37 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP5
38 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
39 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP17
40 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
41 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G15700
42 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G55690
43 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATHB-2; ATHB2; HAT4; HB-2
44 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G05190
45 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G61920
46 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NDF4
47 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G47310
48 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G22355
49 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G23770
50 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G25490
51 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  BBX32; EIP6
52 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32295
53 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  FSD2
54 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G50180
55 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HCF136
56 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G11550
57 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G63350
58 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G10710
59 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TOE2
60 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ACX1
61 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32190
62 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G38430
63 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HDG4
64 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G10970
65 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G35250
66 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CDKC;1
67 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G13440
68 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATSEN1; DIN1; SEN1; SEN1
69 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G01920
70 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASE2; ATASE2; ATPURF2; CIA1
71 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MARD1
72 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATAIG1; BHLH32; TMO5
73 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATGRXCP; CXIP1
74 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G15640
75 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
76 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATVAMP714; VAMP714; VAMP714
77 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
78 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  VPS9B
79 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G17486
80 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AO
81 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ROXY2
82 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G09250
83 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NZZ; SPL
84 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CHR3; SYD
85 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G37000
86 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP10
87 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
88 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
89 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATRBP45B; RBP45B
90 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G05710
91 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G32160
92 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ZFP7
93 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G06450
94 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATMKK9
95 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
96 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G11800
97 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NTRC
98 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  KDSB
99 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  APL; WDY
100 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G38000
101 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PDH-E1 BETA
102 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ANAC041; NAC041
103 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G09660
104 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G12810
105 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PSAD-2
106 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SKL2
107 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G03500
108 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G21860
109 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SMU1
110 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G45850
111 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TAF15
112 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G25730
113 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G24860
114 AT5G42470  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G17970
115 AT5G42470  --  interacts with  --  AT4G32960  --  interacts with  --  ATXR5; PDE336; SDG15
116 AT5G42470  --  interacts with  --  AT4G32960  --  interacts with  --  AT4G29930
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact