Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G48385
Type: Protein GRN ID: np41483 Name:
Annotation: FRIGIDA-like protein
Gene Locus: AT5G48385
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8
3 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440
4 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440
5 AT5G48385  --  interacts with  --  AT4G14900
6 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3
7 AT5G48385  --  interacts with  --  AT5G19080
8 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
9 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G13990
10 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ATU2AF65A
11 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT5G66250
12 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ROXY2
13 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT5G59210
14 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ALF4
15 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  PPD2; TIFY4B
16 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  NINJA
17 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT1G11810
18 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  INO
19 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
20 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT4G15700
21 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT1G67170
22 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT1G56150
23 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT4G32440
24 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT3G18140
25 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT3G28715
26 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT4G32190
27 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ARR14
28 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
29 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  NARA5
30 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT3G03000
31 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT2G30880
32 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AT2G30540
33 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
34 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  interacts with  --  IMPA-2
35 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.877438) with  --  AT2G37220
36 AT5G48385  --  interacts with  --  TIFY8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971779) with  --  EMB2784; RPL4
37 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  PCB2
38 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  ATSPX4; SPX4
39 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  ATRBP45B; RBP45B
40 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  AT1G07840
41 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  AT1G20880
42 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  AT3G21215
43 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  AT1G33470
44 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  QWRF1; SCO3
45 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  AT1G06450
46 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  ATPRMT4B; PRMT4B
47 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  interacts with  --  HLH1; PAR1
48 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G22440  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.861791) with  --  ARR1
49 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  KAN; KAN1
50 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT1G31050
51 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
52 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  RFI2
53 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  LSU1
54 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  BRX
55 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT4G01090
56 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT5G38640
57 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT2G45360
58 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT4G21705
59 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G56680
60 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT5G38420
61 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G51180
62 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
63 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT3G61790
64 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  CDKC;1
65 AT5G48385  --  interacts with  --  AT1G01440  --  interacts with  --  AT1G49850
66 AT5G48385  --  interacts with  --  AT4G14900  --  interacts with  --  AT5G22355
67 AT5G48385  --  interacts with  --  AT4G14900  --  interacts with  --  ATGLK1; GLK1; GPRI1
68 AT5G48385  --  interacts with  --  AT4G14900  --  interacts with  --  ATBPM3; BPM3
69 AT5G48385  --  interacts with  --  AT4G14900  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.821964) with  --  AT1G78150
70 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT4G28230
71 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
72 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT5G57210
73 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT4G39050
74 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT4G17680
75 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67
76 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT5G28900
77 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT1G64180
78 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT3G01435
79 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  FMA
80 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT5G20030
81 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2
82 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  CDC2B; CDKB1;1
83 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT1G01880
84 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1
85 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  ATCDK8; CDKE;1; HEN3
86 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3
87 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  AT;CDKD;1; CAK3AT; CDKD1;1
88 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  CDKB2;1
89 AT5G48385  --  interacts with  --  CYCA2;3  --  interacts with  --  CDKB1;2
90 AT5G48385  --  interacts with  --  AT5G19080  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2
91 AT5G48385  --  interacts with  --  AT5G19080  --  interacts with  --  UBC18
92 AT5G48385  --  interacts with  --  AT5G19080  --  interacts with  --  UBC16
93 AT5G48385  --  interacts with  --  AT5G19080  --  interacts with  --  AT3G12470
94 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  DAR2
95 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  DA1
96 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP3
97 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP5
98 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
99 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
100 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP17
101 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
102 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
103 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G51910
104 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP8
105 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
106 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G35560
107 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  SPY
108 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G14980
109 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G41730
110 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PI
111 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G23770
112 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PYE
113 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AtTHO6; DWA1; THO6
114 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G24900
115 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G36750
116 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
117 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G24860
118 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PLP3b
119 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  CYP705A15
120 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  FSD2
121 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G22720
122 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  MOS1
123 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G30050
124 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT4G36110
125 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  HSD1
126 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATHSD1; HSD1
127 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G31985
128 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G45010
129 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G66240
130 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT5G17180
131 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT3G58510
132 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  APRR5; PRR5
133 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATPRR1; PRR1
134 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  NZZ; SPL
135 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  SRFR1
136 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  RGA1
137 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
138 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  TCP10
139 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT2G37000
140 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G49030
141 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G51580
142 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G05710
143 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G22630
144 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G25550
145 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  OHP2
146 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G64460
147 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  CLP2; CLPR2; EMB3146; NCLPP2
148 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G52695
149 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  ATERF12
150 AT5G48385  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15  --  interacts with  --  AT1G67800
151 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G13990  --  interacts with  --  TOE2
152 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G13990  --  interacts with  --  AT1G13730
153 AT5G48385  --  interacts with  --  AT3G13990  --  interacts with  --  AT2G03640
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact