Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AVA-P4
Type: Protein GRN ID: np18223 Name: AVA-P4
Annotation: AVA-P4 | vacuolar H+-pumping ATPase 16 kDa proteolipid subunit 4 [TCDB:2.A.66.1] [TCDB:2.A.72.1] [TCDB:2.A.72.2] [TCDB:2.A.72.3] [EC:3.6.3.14]
Gene Locus: AT1G75630
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 262924_s_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G32750
3 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G75880
4 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450
5 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240
6 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin
7 AVA-P4  --  transport  --  Methotrexate
8 AVA-P4  --  transport  --  Folate
9 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G32750  --  interacts with  --  NAPRT2
10 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G75880  --  interacts with  --  AT5G24290
11 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G75880  --  interacts with  --  AT3G16310
12 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G18850
13 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  APE2; TPT
14 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G01430
15 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATB5-A; ATCB5-E; B5 #2; CB5-E
16 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  FIS1B
17 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G24130
18 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G60460
19 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G18150
20 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATVTI11; ATVTI1A; SGR4; VTI11; VTI1A; ZIG; ZIG1
21 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  IRX15-L
22 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G40042
23 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G35080
24 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
25 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATVAMP722; SAR1; VAMP722
26 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G55535
27 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G03410
28 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G16950
29 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G16790
30 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ERG28
31 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G60010
32 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ARL
33 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSYP61; OSM1; SYP61
34 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G44800
35 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G32580
36 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G17080
37 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  WAT1
38 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AGP12; ATAGP12
39 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G51510
40 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G76670
41 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  TOM20-3
42 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATTSPO; TSPO
43 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  7RED; DWF5; LE; PA; ST7R
44 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSPP; SPP
45 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G20300
46 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G17760
47 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATRBL6; RBL6
48 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATPUP4; PUP4
49 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G24290
50 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  PLA IIIB; PLP9
51 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G24310
52 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G17972
53 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G57280
54 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  PIP2;8; PIP3B
55 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G25190
56 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G43520
57 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ROD1
58 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATBET11; ATBS14A; BET11; BS14A
59 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  CASP1
60 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G29034
61 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G02690
62 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATLPP2; ATPAP2; LPP2
63 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G22070
64 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G22570
65 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G77350
66 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSYP51; SYP51
67 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G33800
68 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  DELTA-TIP2; TIP2;2
69 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G05785
70 AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G28250
71 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240  --  interacts with  --  AT2G22510
72 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240  --  interacts with  --  ATCIPK14; ATSR1; CIPK14; PKS24; SnRK3.15; SR1
73 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240  --  interacts with  --  AtMYB6; MYB6
74 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240  --  interacts with  --  AT1G12390
75 AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240  --  is the target gene of  --  ath-miR863-3p
76 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G79990
77 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  ATERDJ2A
78 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  GASA1
79 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G71940
80 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G70740
81 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G65090
82 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  UBC28
83 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  DAA1
84 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  DAL1
85 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G61390
86 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G48980
87 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2
88 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G29820
89 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G28630
90 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G25500
91 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G19650
92 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G15120
93 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G14480
94 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G11330
95 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G11180
96 AVA-P4  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G07650
97 AVA-P4  --  transport  --  Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440
98 AVA-P4  --  transport  --  Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G61360
99 AVA-P4  --  transport  --  Methotrexate  --  is transported by  --  NTL
100 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.3; NAD5C
101 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  NDHH
102 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATNRAMP4; NRAMP4
103 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G64970
104 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCF5; ATGCN5; GCN5
105 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G64700
106 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G62890
107 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCA9; ATATH11; ATH11
108 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCG28
109 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G60710
110 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G59740
111 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATUCP2; UCP2
112 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AHA3; ATAHA3; HA3
113 AVA-P4  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ACA8; AT-ACA8
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact