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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G71940
Type: Protein GRN ID: np18244 Name:
Annotation: SNARE associated Golgi protein family [TCDB:2.A.37.2] [TCDB:2.A.37.4] [TCDB:2.A.72.1] [TCDB:2.A.72.2] [TCDB:2.A.72.3]
Gene Locus: AT1G71940
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 260174_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1
3 AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6
4 AT1G71940  --  transport  --  Lithium
5 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin
6 AT1G71940  --  transport  --  Methotrexate
7 AT1G71940  --  transport  --  Folate
8 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
9 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
10 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  ATHLECRK; HLECRK; LECRK1
11 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT3G42725
12 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT1G10660
13 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  RTH
14 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  CRK31
15 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT4G32600
16 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT1G49230
17 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT5G27370
18 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT3G45700
19 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT4G16620
20 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT3G08930
21 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT4G28330
22 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT1G06890
23 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  AT3G61750
24 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  ATNAP5; NAP5
25 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  interacts with  --  ABCA7; ATATH6; ATH6
26 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.915073) with  --  FDH; KCS10
27 AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.914327) with  --  AT3G43720
28 AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.11659) with  --  AP40; P40; RP40; RPSAA
29 AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.993136) with  --  AT4G10450
30 AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.830141) with  --  AT5G37310
31 AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00739) with  --  AT5G41520
32 AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6  --  interacts with  --  AT4G12950
33 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  COX1
34 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
35 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  ORF291
36 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
37 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
38 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD3
39 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD4L
40 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD4
41 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
42 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
43 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD7
44 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
45 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G76520
46 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  sks5
47 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G72040
48 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  CRK3
49 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  ASG6; CRK2
50 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G69100
51 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  BZO1
52 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G61390
53 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G61360
54 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G59950
55 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  PSAG
56 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G50060
57 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G49490
58 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G43910
59 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G22870
60 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G22700
61 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  PRO25; WAK1
62 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G17230
63 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G17150
64 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AtRH36; RH36; SWA3
65 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G16260
66 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  WAKL4
67 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  WAKL2
68 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G14730
69 AT1G71940  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G07200
70 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G79990
71 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  ATERDJ2A
72 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  GASA1
73 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AVA-P4
74 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G70740
75 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G65090
76 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  UBC28
77 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  DAA1
78 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  DAL1
79 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G48980
80 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2
81 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G29820
82 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G28630
83 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G25500
84 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G19650
85 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G15120
86 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G14480
87 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G11330
88 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G11180
89 AT1G71940  --  transport  --  Biopterin  --  is transported by  --  AT1G07650
90 AT1G71940  --  transport  --  Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440
91 AT1G71940  --  transport  --  Methotrexate  --  is transported by  --  NTL
92 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.3; NAD5C
93 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  NDHH
94 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATNRAMP4; NRAMP4
95 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G64970
96 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCF5; ATGCN5; GCN5
97 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G64700
98 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G62890
99 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCA9; ATATH11; ATH11
100 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCG28
101 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G60710
102 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G59740
103 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATUCP2; UCP2
104 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AHA3; ATAHA3; HA3
105 AT1G71940  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ACA8; AT-ACA8
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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