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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ABCF5; ATGCN5; GCN5
Type: Protein GRN ID: np42202 Name: ABCF5; ATGCN5; GCN5
Annotation: GCN5, ATGCN5 | general control non-repressible 5 [TCDB:2.A.29.10] [TCDB:2.A.29.11] [TCDB:2.A.29.13] [TCDB:2.A.29.14] [TCDB:2.A.29.17] [TCDB:2.A.29.20] [TCDB:2.A.29.23] [TCDB:2.A.29.27]
Gene Locus: AT5G64840
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 247222_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22
3 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.946708) with  --  ftsh9
4 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate
5 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  FAD
6 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  AT5G08720
7 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  AT1G62780
8 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  ATHSPRO2; HSPRO2
9 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  AT5G42220
10 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  AT1G77580
11 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  AT4G28650
12 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  AT1G75370
13 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2
14 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  interacts with  --  PUB22  --  interacts with  --  RPN12a
15 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.946708) with  --  ftsh9  --  is the target gene of  --  ath-miR5012
16 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.3; NAD5C
17 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  NDHH
18 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATNRAMP4; NRAMP4
19 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G64970
20 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G64700
21 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G62890
22 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCA9; ATATH11; ATH11
23 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ABCG28
24 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G60710
25 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT5G59740
26 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATUCP2; UCP2
27 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AHA3; ATAHA3; HA3
28 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ACA8; AT-ACA8
29 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT4G01440
30 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G79990
31 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  ATERDJ2A
32 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  GASA1
33 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AVA-P4
34 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G71940
35 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G70740
36 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G65090
37 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  UBC28
38 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  DAA1
39 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  DAL1
40 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G61390
41 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G48980
42 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2
43 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G29820
44 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G28630
45 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G25500
46 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G19650
47 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G15120
48 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G14480
49 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G11330
50 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G11180
51 ABCF5; ATGCN5; GCN5  --  transport  --  Folate  --  is transported by  --  AT1G07650
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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