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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node Methotrexate
Type: Compound GRN ID: nc51937 Name: Methotrexate
Annotation: Methotrexate
KEGG Acc.: C01937
CHEBI ID:
Formula: C20H22N8O5
M.W.: 454.4393
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440
3 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G79990
4 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A
5 Methotrexate  --  is transported by  --  GASA1
6 Methotrexate  --  is transported by  --  AVA-P4
7 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G71940
8 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G70740
9 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G65090
10 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28
11 Methotrexate  --  is transported by  --  DAA1
12 Methotrexate  --  is transported by  --  DAL1
13 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G61390
14 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G61360
15 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G48980
16 Methotrexate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2
17 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G29820
18 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G28630
19 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G25500
20 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G19650
21 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G15120
22 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G14480
23 Methotrexate  --  is transported by  --  NTL
24 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11330
25 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11180
26 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G07650
27 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Nickel(2+)
28 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Mitoxantrone
29 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Selenite
30 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Phospholipid
31 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Folate
32 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Retinal
33 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Sterol
34 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Cholesterol
35 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Sulfate
36 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Zinc cation
37 Methotrexate  --  is transported by  --  AT4G01440  --  transport  --  Heme
38 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G79990  --  transport  --  Biopterin
39 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AT4G23030
40 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ACBK1; ATCNGC10; CNGC10
41 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  KAT1
42 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ATPTR2; ATPTR2-B; NTR1; PTR2; PTR2-B
43 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ATCNGC13; CNGC13
44 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  OEP61; TPR7
45 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ATNRT2.6; NRT2.6
46 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ATSUC7; SUC7
47 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AT1G80510
48 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AT1G66760
49 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  FLA2
50 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AtCML8; CAM8
51 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AT1G08890
52 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  LAX1
53 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ATECA2; ECA2
54 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
55 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
56 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AT2G38510
57 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  ATCNGC5; CNGC5
58 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  interacts with  --  AT5G15240
59 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  is the target gene of  --  ath-miR2933b
60 Methotrexate  --  is transported by  --  ATERDJ2A  --  is the target gene of  --  ath-miR2933a
61 Methotrexate  --  is transported by  --  GASA1  --  is the target gene of  --  ath-miR2937
62 Methotrexate  --  is transported by  --  AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G32750
63 Methotrexate  --  is transported by  --  AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G75880
64 Methotrexate  --  is transported by  --  AVA-P4  --  interacts with  --  AT4G26450
65 Methotrexate  --  is transported by  --  AVA-P4  --  interacts with  --  AT1G01240
66 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G71940  --  interacts with  --  HHP1
67 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G71940  --  interacts with  --  HAP6
68 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G71940  --  transport  --  Lithium
69 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G65090  --  interacts with  --  AtMC9; AtMCP2f; MC9; MCP2f
70 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  interacts with  --  AT4G10080
71 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB6
72 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB5
73 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB4
74 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  interacts with  --  ATGP4
75 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB2
76 Methotrexate  --  is transported by  --  UBC28  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.944578) with  --  ATDI19; DI19
77 Methotrexate  --  is transported by  --  DAL1  --  interacts with  --  AT4G01410
78 Methotrexate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2  --  transport  --  5-FU
79 Methotrexate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2  --  transport  --  Allantoin
80 Methotrexate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2  --  transport  --  Xanthine
81 Methotrexate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2  --  transport  --  Urate
82 Methotrexate  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2  --  transport  --  Uracil
83 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G19650  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.810415) with  --  AT1G12080
84 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G19650  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.809101) with  --  ATHB20; HB20
85 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G19650  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.896548) with  --  AT5G16990
86 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G19650  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.830294) with  --  AT5G19340
87 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11330  --  interacts with  --  AT5G47180
88 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11330  --  interacts with  --  AT2G16030
89 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11330  --  interacts with  --  AT5G19700
90 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11330  --  interacts with  --  AT4G38690
91 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G11330  --  interacts with  --  AT4G05370
92 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G07650  --  interacts with  --  AT3G26370
93 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G07650  --  interacts with  --  AT1G54540
94 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G07650  --  interacts with  --  AT1G34470
95 Methotrexate  --  is transported by  --  AT1G07650  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.874151) with  --  AT1G29670
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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