Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G30260
Type: Protein GRN ID: np14120 Name:
Annotation: BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT4G21060.1); Has 30 Blast hits to 30 proteins in 8 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 30; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT1G30260
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245776_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810
3 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA
4 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G18260
5 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATNDPK2; NDPK IA; NDPK IA IA; NDPK1A; NDPK2
6 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  MED10A
7 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AtTHO5; THO5
8 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G58530
9 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G30490
10 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PFN3; PRF3
11 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
12 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  NFD1
13 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  CW7
14 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT2G35240
15 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
16 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  SNRK2-10; SNRK2.10; SRK2B
17 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PFN2; PRF2; PRO2
18 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PYE
19 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G11550
20 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ASP3; YLS4
21 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G03140
22 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G70100
23 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT3G27350
24 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT2G16880
25 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
26 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ELF7
27 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT4G05400
28 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATWRKY17; WRKY17
29 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PYM; UVI4
30 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G58070
31 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G31240
32 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  SNZ
33 AT1G30260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G10060
34 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  SLAC1 CDI3
35 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT5G44090
36 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  PRS2
37 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  GIP1
38 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT1G66070
39 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  TAF15
40 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AtTHO6; DWA1; THO6
41 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT4G24900
42 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT2G47960
43 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT5G60340
44 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ATMSRB3; MSRB3
45 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT5G25475
46 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  OBF5
47 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ACR6
48 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT5G62290
49 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  MEE50
50 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT3G58630
51 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  LIP1
52 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT1G31870
53 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ADT4
54 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  UCH1
55 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT4G28180
56 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT3G11590
57 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ATM10; M10
58 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  FRS3
59 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ATB' BETA
60 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT2G17860
61 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT3G13670
62 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  PIN3
63 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  pin2/AGR
64 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ATPIN1
65 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
66 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT1G15730
67 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT1G22790
68 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  AT1G20770
69 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  NPL1; PHOT2
70 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ATCHIP; CHIP
71 AT1G30260  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA  --  interacts with  --  ATB' GAMMA
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab