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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G18260
Type: Protein GRN ID: np41180 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein
Gene Locus: AT5G18260
Transcription factor /
transcriptional regulator:
chromatin regulator family PHD
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2
3 AT5G18260  --  interacts with  --  AT1G20360
4 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550
5 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX
6 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810
7 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  SEC10
8 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  SEC6
9 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  BOI; RING
10 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  PSAD-1
11 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ROH1
12 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  5PTASE11; AT5PTASE11
13 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT1G29120
14 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT1G31870
15 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT1G49580
16 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
17 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ATCAND1
18 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  FZF
19 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ATEXO70H1; EXO70H1
20 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
21 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  PATL1
22 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  PBF1
23 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT3G07480
24 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  PSAD-2
25 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT2G39100
26 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ATMAP70-1; MAP70-1
27 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT4G02720
28 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT4G33690
29 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT3G59350
30 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT4G17680
31 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT1G79910
32 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT1G49850
33 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  PYM; UVI4
34 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ATERF12
35 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT5G15080
36 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT4G20300
37 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT1G04930
38 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT4G30490
39 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  KAN; KAN1
40 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ENA
41 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  ATCYTC-A; CYTC-1
42 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT3G01300
43 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  WRKY21
44 AT5G18260  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2  --  interacts with  --  AT2G43370
45 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  AT3G61920
46 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  HAT14
47 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
48 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  EMB139; EMB506
49 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  LIP1
50 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  TOE2
51 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  AT5G65683
52 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2
53 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
54 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  AT3G10970
55 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  ATAIG1; BHLH32; TMO5
56 AT5G18260  --  interacts with  --  AT3G48550  --  interacts with  --  AT2G30120
57 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  CYP90A/CPD/CBB3
58 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATCPK1; CPK1
59 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATPK7; D6PKL3
60 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  NGA1
61 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATWRKY17; WRKY17
62 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AtPFA-DSP2; PFA-DSP2
63 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT3G59200
64 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AtWRKY20; WRKY20
65 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT3G62790
66 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATFIP37; FIP37
67 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT4G08460
68 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATMEK4; ATMKK4; MKK4
69 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT5G22310
70 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATEIF3G1; EIF3G1
71 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT4G21720
72 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  HCF136
73 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT5G10160
74 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT3G28715
75 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
76 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT5G59250
77 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT1G01440
78 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT1G05710
79 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ABCI18; ATNAP4; NAP4
80 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  AT1G01210
81 AT5G18260  --  interacts with  --  BRX  --  interacts with  --  ARF5
82 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATNDPK2; NDPK IA; NDPK IA IA; NDPK1A; NDPK2
83 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  MED10A
84 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AtTHO5; THO5
85 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G58530
86 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G30490
87 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PFN3; PRF3
88 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
89 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  NFD1
90 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  CW7
91 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT2G35240
92 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
93 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  SNRK2-10; SNRK2.10; SRK2B
94 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PFN2; PRF2; PRO2
95 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  PYE
96 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G11550
97 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G30260
98 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ASP3; YLS4
99 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G03140
100 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G70100
101 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT3G27350
102 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT2G16880
103 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
104 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  ELF7
105 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT4G05400
106 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G58070
107 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT1G31240
108 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  SNZ
109 AT5G18260  --  interacts with  --  AT5G13810  --  interacts with  --  AT5G10060
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


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