Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node OBF4
Type: Protein GRN ID: np08030 Name: OBF4
Annotation: TGA4, OBF4 | TGACG motif-binding factor 4
Gene Locus: AT5G10030
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family bZIP
References:
  • Kesarwani M, Yoo J, Dong X. Genetic interactions of TGA transcription factors in the regulation of pathogenesis-related genes and disease resistance in Arabidopsis. Plant Physiol. 2007 May;144(1):336-46. Epub 2007 Mar 16. PubMed PMID: 17369431; PubMed Central PMCID: PMC1913812.
 
Pathways: Salicylic acid;  Gibberellins;  null;  Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250463_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1
3 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?
4 OBF4  --  interacts with  --  OBP1
5 OBF4  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3
6 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1
7 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?
8 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG
9 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  OCP3
10 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  ASU1; ATDCL1; CAF; DCL1; EMB60; EMB76; SIN1; SUS1
11 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  AT1G77920
12 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  ATWRKY62; WRKY62
13 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  AtWRKY54 family118, transcription factor gene
14 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  WRKY18 family117, transcription factor gene
15 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  AtWRKY58
16 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  ATNPR3; NPR3
17 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  NIMIN-2
18 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  ATSKL1; SKL1
19 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  NIMIN-3
20 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  unknown receptor
21 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  CIPK11; PKS5; SIP4; SNRK3.22
22 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  interacts with  --  NIMIN-1; NIMIN1
23 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  is a member of  --  NNPR1
24 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  is regulated by  --  nitric oxide
25 OBF4  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1  --  is regulated by  --  WRKY18
26 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
27 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARF3
28 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G50680
29 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  TCP16
30 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
31 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  TCP3
32 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
33 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
34 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
35 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
36 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
37 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
38 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
39 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
40 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
41 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
42 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
43 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
44 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  KNAT3
45 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
46 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
47 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  anac032; NAC032
48 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
49 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
50 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
51 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
52 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
53 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
54 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
55 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
56 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
57 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
58 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
59 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
60 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
61 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
62 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
63 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
64 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
65 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
66 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
67 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
68 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
69 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
70 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
71 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
72 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
73 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
74 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
75 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
76 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
77 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
78 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
79 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
80 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
81 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
82 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  FCA
83 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
84 OBF4  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BSH; CHE1
85 OBF4  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3  --  interacts with  --  ACBP2
86 OBF4  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3  --  interacts with  --  RGA1
87 OBF4  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1
88 OBF4  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3  --  interacts with  --  ACBP4
89 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  MKK7
90 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  GRX480; roxy19
91 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  ATSIZ1
92 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  PAD4
93 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  SSI4
94 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  SNI1
95 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  interacts with  --  DTH9
96 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Fe3+
97 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Aluminium
98 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate
99 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Ornithine
100 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Mannitol
101 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Thiamine
102 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Lactose
103 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Maltose
104 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Sucrose
105 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  transport  --  Iron
106 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is a member of  --  PR1 family109, coding gene
107 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is regulated by  --  ARR2 complex18
108 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is regulated by  --  BZIP45
109 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is regulated by  --  OBF5
110 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is regulated by  --  PTAC/ATUHY1/ATWHY1
111 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is regulated by  --  AHBP-1B
112 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  is regulated by  --  TGA3
113 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK6
114 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK8
115 OBF4  --  regulates the expression of   --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831662) with  --  AT5G10760
116 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  regulates the expression of   --  AGL24
117 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  regulates the expression of   --  spl3
118 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  regulates the expression of   --  ap1
119 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  GRF3; RCI1
120 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  ATTCP18; BRC1; TCP18
121 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  AT5G06850
122 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  AT2G18876
123 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  AT2G21230
124 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  ABF4/AREB2
125 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  ATBZIP27; BZIP27; FDP
126 OBF4  --  regulates the expression of   --  FT?  --  interacts with  --  FD
127 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  is regulated by  --  CDF1
128 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  GI
129 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP2B; HAP2B; NF-YA2; UNE8
130 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YC3
131 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  CBFS
132 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT5G65683
133 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  AS1
134 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  COP1
135 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  ADO2; LKP2
136 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YB2
137 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
138 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  HAP5C; NF-YC9
139 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5B; HAP5B; NF-YC2
140 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5A; HAP5A; NF-YC1
141 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT1G72390
142 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT3G18380
143 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  OBE1
144 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  ABI3
145 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA4
146 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA3
147 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA2
148 OBF4  --  is regulated by  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact