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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node LFY
Type: Protein GRN ID: np06041 Name: LFY
Annotation: LFY, LFY3 | floral meristem identity control protein LEAFY (LFY)
Gene Locus: AT5G61850
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family LFY
Pathways: Gibberellins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 247490_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1
3 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD
4 LFY  --  interacts with  --  MYB17
5 LFY  --  interacts with  --  UFO
6 LFY  --  regulates the expression of   --  CAL
7 LFY  --  regulates the expression of   --  AG
8 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1
9 LFY  --  is regulated by  --  spl family, transcription factor gene
10 LFY  --  is regulated by  --  SOC1
11 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33
12 LFY  --  is regulated by  --  GBF1
13 LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1  --  interacts with  --  TUB3
14 LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1  --  interacts with  --  TUA6
15 LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1  --  modify  --  TUB1
16 LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1  --  is modified by  --  MPK16
17 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD35
18 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD40
19 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF18
20 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF3
21 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HSI2; VAL1
22 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G51120
23 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G50680
24 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATE2FA; E2F3
25 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HMGB4; NFD04; NFD4
26 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP5
27 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT5G51910
28 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP16
29 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
30 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G72010
31 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP3
32 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  FAF1
33 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G76870
34 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
35 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
36 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT2G26940
37 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  KNAT3
38 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  anac046; NAC046
39 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL4
40 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL2
41 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TOE2
42 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  Rap2.6L
43 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP70; bZIP70
44 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATBZIP42; bZIP42
45 LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP3; bZIP3
46 LFY  --  interacts with  --  UFO  --  interacts with  --  ASK14; SK14
47 LFY  --  interacts with  --  UFO  --  interacts with  --  ASK19; SK19
48 LFY  --  interacts with  --  UFO  --  interacts with  --  ASK12; SK12
49 LFY  --  interacts with  --  UFO  --  interacts with  --  ASK9; SK9
50 LFY  --  interacts with  --  UFO  --  interacts with  --  ASK3; SK3
51 LFY  --  regulates the expression of   --  CAL  --  interacts with  --  AGL24
52 LFY  --  regulates the expression of   --  CAL  --  interacts with  --  AGL22; SVP
53 LFY  --  regulates the expression of   --  CAL  --  interacts with  --  AGL9; SEP3
54 LFY  --  regulates the expression of   --  CAL  --  interacts with  --  AT1G48150
55 LFY  --  regulates the expression of   --  CAL  --  is regulated by  --  ALC
56 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  ATH1
57 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  AP3; ATAP3
58 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  AT3G11000
59 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  CRC
60 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  AT1G47610
61 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1
62 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  regulates the expression of   --  JGL; NUB
63 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  is regulated by  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN
64 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  is regulated by  --  PGA6; WUS; WUS1
65 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL16
66 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL13
67 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  ful
68 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL6
69 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL4; SEP2
70 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1
71 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  PI
72 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  FLOR1; FLR1
73 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL97
74 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL39
75 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL21
76 LFY  --  regulates the expression of   --  AG  --  interacts with  --  AGL15
77 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  ABS; AGL32; TT16
78 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  AGL27; FLM; MAF1
79 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  BOP2
80 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  BOP1
81 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  ATVIT1; VIT1
82 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  AGL92
83 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  AGL86
84 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  AGL3; SEP4
85 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  interacts with  --  SEU
86 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  is regulated by  --  FT?
87 LFY  --  regulates the expression of   --  ap1  --  is regulated by  --  SPL8
88 LFY  --  is regulated by  --  spl family, transcription factor gene  --  has family member  --  spl5
89 LFY  --  is regulated by  --  spl family, transcription factor gene  --  has family member  --  spl4
90 LFY  --  is regulated by  --  spl family, transcription factor gene  --  has family member  --  spl3
91 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  regulates the expression of   --  CBFS
92 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  is regulated by  --  FLC
93 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  RID3
94 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AT5G47590
95 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL71
96 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL44; ANR1
97 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL42
98 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL19; GL19
99 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL17
100 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL14
101 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL12; XAL1
102 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL5; SHP2
103 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL1; SHP1
104 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AT2G24550
105 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  ARR14
106 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  TPR3
107 LFY  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  TPR2
108 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is a member of  --  MYBFAMILY, transcription factor gene
109 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  interacts with  --  AT1G25320
110 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  interacts with  --  CRK40
111 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is the target gene of  --  ath-miR319c
112 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is the target gene of  --  ath-miR159c
113 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is the target gene of  --  ath-miR319b
114 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is the target gene of  --  ath-miR319a
115 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is the target gene of  --  ath-miR159b
116 LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33  --  is the target gene of  --  ath-miR159a
117 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  interacts with  --  HYH
118 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  interacts with  --  HY5
119 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  interacts with  --  ATGLK2; GLK2; GPRI2
120 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  interacts with  --  ATGLK1; GLK1; GPRI1
121 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  interacts with  --  GIP1
122 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  interacts with  --  AtbZIP16; bZIP16
123 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  regulates the expression of   --  CAT2
124 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  regulates the expression of   --  RBCS1A
125 LFY  --  is regulated by  --  GBF1  --  is modified by  --  CKB1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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