Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATSIZ1
Type: Protein GRN ID: np03038 Name: ATSIZ1
Annotation: ATSIZ1, SIZ1 | DNA-binding protein with MIZ/SP-RING zinc finger, PHD-finger and SAP domain
Gene Locus: AT5G60410
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 chromatin regulator family PHD
References:
  • Cheong MS, Park HC, Bohnert HJ, Bressan RA, Yun DJ. Structural and functional studies of SIZ1, a PIAS-type SUMO E3 ligase from Arabidopsis. Plant Signal Behav. 2010 May 5;5(5). [Epub ahead of print] PubMed PMID: 20404572.
 
Pathways: Abscisic acid;  Salicylic acid;  Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 247630_at    247629_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1
3 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLD
4 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC
5 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5
6 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2
7 ATSIZ1  --  interacts with  --  GNR1; NIA1; NR1
8 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2
9 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1
10 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  interacts with  --  MKK7
11 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  interacts with  --  GRX480; roxy19
12 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  interacts with  --  PAD4
13 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  interacts with  --  SSI4
14 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  interacts with  --  SNI1
15 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  interacts with  --  DTH9
16 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Fe3+
17 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Aluminium
18 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate
19 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Ornithine
20 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Mannitol
21 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Thiamine
22 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Lactose
23 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Maltose
24 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Sucrose
25 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  transport  --  Iron
26 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is a member of  --  PR1 family109, coding gene
27 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  ARR2 complex18
28 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  OBF4
29 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  TGA1
30 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  BZIP45
31 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  OBF5
32 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  PTAC/ATUHY1/ATWHY1
33 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  AHBP-1B
34 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  is regulated by  --  TGA3
35 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK6
36 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK8
37 ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831662) with  --  AT5G10760
38 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  interacts with  --  PFT1
39 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP
40 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  interacts with  --  AGL16
41 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1
42 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  is regulated by  --  AT3G48430
43 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  is regulated by  --  CBFS
44 ATSIZ1  --  interacts with  --  FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67
45 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABI4
46 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABF1 family47, transcription factor gene
47 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ATEM6; EM6; GEA6
48 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AtWRKY2
49 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  sdir1
50 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AFP1
51 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ABI3
52 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  SNRK2-3 family52, coding gene
53 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR6
54 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR5
55 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR4
56 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  WRKY18
57 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  W-BOX
58 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ATWRKY60; WRKY60
59 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  HY5
60 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
61 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
62 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF3
63 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF1
64 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG1
65 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-3
66 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-2
67 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  HAI1
68 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  COR27
69 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CIR1; RVE2
70 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AO
71 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCAD5; CAD-5; CAD5
72 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G23050
73 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G16670
74 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT3G48510
75 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
76 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP2
77 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G10585
78 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATBZIP12; DPBF4; EEL
79 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ACS10
80 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DRB1
81 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CCH/CHLH/GUN5
82 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATGSK1; ATSK2-3; ATSK22; BIL2; GSK1; SK22
83 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ASKdZeta
84 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  FCA
85 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtMYB49; MYB49
86 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SSP4
87 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC072; RD26
88 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABI1
89 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G25160
90 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATWNK2; WNK2; ZIK3
91 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
92 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-B11; PP2-B11
93 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  anac032; NAC032
94 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G76210
95 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-A5; PP2-A5
96 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC019; NAC019
97 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  RAP2.4
98 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DCAF1
99 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  TAP46
100 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
101 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  KEG
102 ATSIZ1  --  interacts with  --  ABI5  --  is modified by  --  AT5G21326
103 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  AT5G38640
104 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  GF14 CHI; GRF1
105 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  GRF3; RCI1
106 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  14-3-3OMEGA
107 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  GF14 PI; GRF13
108 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  GF14 MU; GRF9
109 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  interacts with  --  AtLOG3
110 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2  --  is regulated by  --  HYH
111 ATSIZ1  --  interacts with  --  GNR1; NIA1; NR1  --  interacts with  --  AT5G56220
112 ATSIZ1  --  interacts with  --  GNR1; NIA1; NR1  --  interacts with  --  ATVHA-C; DET3
113 ATSIZ1  --  interacts with  --  GNR1; NIA1; NR1  --  is modified by  --  CPK17
114 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
115 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT1G29630
116 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  DME
117 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  CMT2
118 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  PKDM7D
119 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  ASHH2; CCR1; EFS; LAZ2; SDG8
120 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT2G44410
121 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT5G04460
122 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT1G66650
123 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT3G07200
124 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT1G67180
125 ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2  --  interacts with  --  AT5G48655
126 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  AT3G53690
127 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  SKL2
128 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  AT5G53140
129 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  AT1G08800
130 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  AT2G22100
131 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  EMB3101
132 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  interacts with  --  ARC6
133 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06799) with  --  AT2G30695
134 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.28065) with  --  CLPP6; NCLPP1; NCLPP6
135 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.31766) with  --  ATYLMG1-1; emb1990; YLMG1-1
136 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.21467) with  --  AT3G08740
137 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.29859) with  --  AT3G12930
138 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.23328) with  --  AT3G20230
139 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.878634) with  --  AT3G27180
140 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.13506) with  --  DAL; DAL1
141 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.2858) with  --  BSM
142 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02679) with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
143 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.18116) with  --  SAMC1; SAMT1
144 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.27491) with  --  AT3G51140
145 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.01535) with  --  CP29
146 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.19088) with  --  ATDEF2; DEF2; PDF1B
147 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.834587) with  --  AT5G55580
148 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17545) with  --  EMB3143
149 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.35811) with  --  AT5G59500
150 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.27414) with  --  AT4G36390
151 ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1  --  is modified by  --  STN8
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact