Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node 4-Aminobutanoate
Type: Compound GRN ID: nc50334 Name: 4-Aminobutanoate
Annotation: 4-Aminobutanoate; 4-Aminobutanoic acid; 4-Aminobutyrate; 4-Aminobutyric acid; gamma-Aminobutyric acid; GABA
KEGG Acc.: C00334
CHEBI ID:
Formula: C4H9NO2
M.W.: 103.1198
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 4-Aminobutanoate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Succinate semialdehyde
3 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1
4 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD5
5 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD4
6 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD3
7 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p
8 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-5p
9 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD2
10 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1
11 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
12 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
13 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L
14 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
15 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6
16 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ZIP8
17 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
18 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
19 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
20 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420
21 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42210
22 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
23 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800
24 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41760
25 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
26 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
27 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  YSL4
28 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
29 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1
30 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40670
31 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40240
32 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2
33 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1
34 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT2G18193
35 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G80400
36 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30
37 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G51350
38 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G09440
39 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420
40 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G03550
41 4-Aminobutanoate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Succinate semialdehyde  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GABA-T; HER1; POP2
42 4-Aminobutanoate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Succinate semialdehyde  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Glyoxylate
43 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  interacts with  --  GF14 CHI; GRF1
44 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.972107) with  --  ATMVD1; MVD1
45 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.04214) with  --  AT1G22440
46 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.823083) with  --  AT1G76550
47 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.807006) with  --  AT3G19390
48 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.944523) with  --  GPK1
49 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.852962) with  --  AT4G18975
50 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831051) with  --  AT4G31340
51 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.866342) with  --  AT5G35580
52 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.81864) with  --  AT5G44000
53 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.874652) with  --  FPS1
54 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p  --  inhibit the expression of  --  AT5G57700
55 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p  --  inhibit the expression of  --  AT5G22760
56 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p  --  inhibit the expression of  --  AT4G29490
57 4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p  --  inhibit the expression of  --  AT2G31215
58 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.896409) with  --  AT2G07711
59 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.896409) with  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
60 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Lithium
61 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-2,4-Diaminobutanoate
62 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Phenylalanine
63 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Ornithine
64 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Methylamine
65 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-Leucine
66 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Phenylalanine
67 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-Trp
68 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-Lysine
69 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.977602) with  --  NAD9
70 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06286) with  --  ORF25
71 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  Nickel(2+)
72 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  L-Methionine
73 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  Cu2+
74 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  Zinc cation
75 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A  --  transport  --  Polyamine
76 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6  --  transport  --  L-Isoleucine
77 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6  --  transport  --  L-Valine
78 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6  --  transport  --  L-Asparagine
79 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6  --  transport  --  L-Proline
80 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6  --  transport  --  Tyrosine
81 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ZIP8  --  transport  --  Betaine
82 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ZIP8  --  transport  --  L-Threonine
83 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1  --  interacts with  --  AT5G19570
84 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1  --  interacts with  --  AT2G42390
85 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.834194) with  --  AT3G21770
86 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.847663) with  --  AT3G54040
87 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.828296) with  --  ATEXO70H1; EXO70H1
88 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.930105) with  --  AT5G17820
89 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  ATRBOH D
90 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  ATELP; ATELP1; ATVSR1; BP-80; BP80; BP80-1;1; BP80B; GFS1; VSR1; VSR1;1
91 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
92 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  ATDTX1; DTX1; TX1
93 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  ADS2; DS2
94 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT5G19130
95 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT4G16444
96 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT4G13530
97 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  TET6
98 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT4G21570
99 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT2G38510
100 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT5G05820
101 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  CYP71B31
102 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420  --  interacts with  --  AT2G25890
103 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.82159) with  --  AT2G17240
104 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.805681) with  --  CDS5
105 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT5G59613
106 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT1G27290
107 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT5G03345
108 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT1G16170
109 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  CRK30
110 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT3G19300
111 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT1G14020
112 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT1G11450
113 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT1G71140
114 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  ATKT2; ATKUP2; KT2; KUP2; SHY3; TRK2
115 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  ELIP2
116 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  ATCESA8; CESA8; IRX1; LEW2
117 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  ATDHAR1; DHAR1; DHAR5
118 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AtMAPR5; ATMP1; MSBP1
119 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  ATFAO3; FAO3
120 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  AT4G12000
121 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800  --  interacts with  --  ATENT6; ENT6
122 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18  --  is the target gene of  --  ath-miR856
123 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18  --  is the target gene of  --  ath-miR780.2
124 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18  --  is the target gene of  --  ath-miR780.1
125 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA  --  interacts with  --  ACBK1; ATCNGC10; CNGC10
126 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA  --  interacts with  --  ATCAT6; CAT6
127 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1  --  interacts with  --  ABCG10
128 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1  --  interacts with  --  ATNHX8; NHX8; NHX8
129 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1  --  interacts with  --  ATCNGC13; CNGC13
130 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1  --  interacts with  --  ATCPK1; CPK1
131 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40670  --  interacts with  --  ATBBD1; BBD1
132 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40670  --  interacts with  --  AT1G15900
133 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Mannopine
134 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  2-Aminoethylphosphonate
135 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Spermidine
136 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2  --  transport  --  Putrescine
137 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1  --  has product (in catalytic reaction)  --  Retinyl ester
138 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1  --  has product (in catalytic reaction)  --  Long-chain ester
139 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1  --  has product (in catalytic reaction)  --  Triacylglycerol
140 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G80400  --  transport  --  Spermine
141 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G80400  --  transport  --  Thiamine
142 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G80400  --  transport  --  Choline
143 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30  --  interacts with  --  ABF4/AREB2
144 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.823108) with  --  PTAC/ATUHY1/ATWHY1
145 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.837927) with  --  AT1G06840
146 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.800455) with  --  AT5G46580
147 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.81425) with  --  AT5G59500
148 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.931191) with  --  ATSIG6; SIG6; SIGF; SOLDAT8
149 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.14827) with  --  LPA3
150 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.992036) with  --  LPA1
151 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.07822) with  --  AT1G50450
152 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.13128) with  --  AT3G08920
153 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10349) with  --  AT3G04550
154 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00963) with  --  PLSP1
155 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.0787) with  --  PGR7
156 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.21726) with  --  AT3G25805
157 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.19541) with  --  AT1G18170
158 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.941317) with  --  PGR3
159 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.913487) with  --  AT4G37510
160 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00096) with  --  AT4G39040
161 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17331) with  --  AT5G28750
162 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.82923) with  --  CYP97B3
163 4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G04420  --  transport  --  Indole
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact