Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G03550
Type: Protein GRN ID: np11789 Name:
Annotation: Secretory carrier membrane protein (SCAMP) family protein [TCDB:2.A.42.1]
Gene Locus: AT1G03550
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 264835_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G03550  --  transport  --  Indole
3 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate
4 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine
5 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp
6 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  has product (in catalytic reaction)  --  D-Glyceraldehyde 3-phosphate
7 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  TSB1
8 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  IGP
9 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  TSBtype2
10 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G28237
11 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  TSB2
12 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G02610
13 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is product (in catalytic reaction) of  --  TSA1
14 AT1G03550  --  transport  --  Indole  --  is transported by  --  AT1G04420
15 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Succinate semialdehyde
16 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD; GAD1
17 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD5
18 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD4
19 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD3
20 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-3p
21 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ath-miR5014a-5p
22 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GAD2
23 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  COX1
24 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
25 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
26 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD4L
27 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
28 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  NAD6
29 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ZIP8
30 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT4; PHT1;3; PHT3
31 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPT1; PHT1;1
32 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  PHT1;6; PHT6
33 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42420
34 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G42210
35 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
36 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41800
37 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G41760
38 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCHX18; CHX18
39 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATPUP12; PUP12
40 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  YSL4
41 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ATCLC-A; ATCLCA; CLC-A; CLC-A; CLCA
42 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  LHT1
43 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40670
44 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT5G40240
45 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AtSDF2; ATSDL; SDF2
46 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  ABX45; AS11; ATDGAT; DGAT1; RDS1; TAG1
47 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT2G18193
48 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G80400
49 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30
50 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G51350
51 AT1G03550  --  transport  --  4-Aminobutanoate  --  is transported by  --  AT1G09440
52 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Tyrosyl-tRNA(Tyr)
53 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Tyramine
54 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-(4-Hydroxyphenyl)pyruvate
55 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G34930
56 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Arogenate
57 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT1G15710
58 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
59 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
60 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  NAD7
61 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  COB
62 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  ATPTR3; PTR3
63 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT5G46040
64 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  HMA7; RAN1
65 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  PHT4;6
66 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  ALA2
67 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  ABCI21; ATNAP2; ATPOP1; POP1
68 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT5G44050
69 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  ATSUC6; SUC6
70 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  APT1; PHT1;2; PHT2
71 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT5G40810
72 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT1G21890
73 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  GONST5
74 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT1G21070
75 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
76 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  PHT1;8
77 AT1G03550  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
78 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  IAOx
79 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  IAM
80 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  TAM
81 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  IPyA
82 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  N,N-Dihydroxy-L-tryptophan
83 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  N-Hydroxy-L-tryptophan
84 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  has product (in catalytic reaction)  --  Indole-3-acetaldehyde oxime
85 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  is transported by  --  ORF291
86 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
87 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
88 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  is transported by  --  NAD3
89 AT1G03550  --  transport  --  L-Trp  --  is transported by  --  NAD4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact