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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node sks5
Type: Protein GRN ID: np10669 Name: sks5
Annotation: sks5 | SKU5 similar 5 [TCDB:2.A.36.1] [TCDB:2.A.36.6] [TCDB:2.A.36.7]
Gene Locus: AT1G76160
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 261728_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221
3 sks5  --  transport  --  Lithium
4 sks5  --  transport  --  NH4+
5 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  NRPC1
6 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  AT5G54410
7 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  ATDCL4; DCL4
8 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  AT4G13070
9 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  AT4G05592
10 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  ATFIP37; FIP37
11 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  AT3G14200
12 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  ANAC043; NST1
13 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  ATXID; XID
14 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  AT1G77660
15 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  HEMB1
16 sks5  --  is the target gene of  --  ath-miR4221  --  inhibit the expression of  --  AT1G20500
17 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  COX1
18 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
19 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  ORF291
20 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
21 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
22 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD3
23 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD4L
24 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD4
25 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
26 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
27 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD7
28 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
29 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G76520
30 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G72040
31 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G71940
32 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  CRK3
33 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  ASG6; CRK2
34 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G69100
35 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  BZO1
36 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G61390
37 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G61360
38 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G59950
39 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  PSAG
40 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G50060
41 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G49490
42 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G43910
43 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G22870
44 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G22700
45 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  PRO25; WAK1
46 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G17230
47 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G17150
48 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AtRH36; RH36; SWA3
49 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G16260
50 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  WAKL4
51 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  WAKL2
52 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G14730
53 sks5  --  transport  --  Lithium  --  is transported by  --  AT1G07200
54 sks5  --  transport  --  NH4+  --  is transported by  --  AST91; SULTR3;3
55 sks5  --  transport  --  NH4+  --  is transported by  --  PIN7
56 sks5  --  transport  --  NH4+  --  is transported by  --  ATSUC2; SUC2; SUT1
57 sks5  --  transport  --  NH4+  --  is transported by  --  AT1G22570
58 sks5  --  transport  --  NH4+  --  is transported by  --  AT1G22550
59 sks5  --  transport  --  NH4+  --  is transported by  --  AT1G22540
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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