Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT3G46890
Type: Protein GRN ID: np25620 Name:
Annotation: BEST Arabidopsis thaliana protein match is: maternal effect embryo arrest 60 (TAIR:AT5G05950.1); Has 124 Blast hits to 124 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 124; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT3G46890
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444
3 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175
4 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020
5 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1
6 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4
7 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ATYLMG2; YLMG2
8 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT1G77350
9 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT1G76185
10 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT1G26180
11 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  APE1
12 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT5G62900
13 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ARAC8; ATRAC8; ATROP10; ROP10
14 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT1G48210
15 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT5G67130
16 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ATNRAMP2; NRAMP2
17 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT5G19440
18 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT4G23930
19 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT3G46160
20 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT3G59850
21 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT5G42420
22 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT2G20790
23 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AT1G66860
24 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  MSS3
25 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AGP27; ATAGP27
26 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  CERK1; LYSM RLK1
27 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ATDHAR1; DHAR1; DHAR5
28 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ARL
29 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  pin2/AGR
30 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1
31 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ARGOS
32 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  ARF3; ARL1; ATARL1
33 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  PRA1.B2
34 AT3G46890  --  interacts with  --  AT4G16444  --  interacts with  --  AtVHP2;1; AVP2; AVPL1; VHP2;1; VP2
35 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175  --  interacts with  --  ATHH2; PIP1;2; PIP1B; TMP-A
36 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175  --  interacts with  --  FOLK
37 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
38 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175  --  interacts with  --  AAP5
39 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175  --  interacts with  --  AT4G10080
40 AT3G46890  --  interacts with  --  AT2G01175  --  interacts with  --  AT1G27190
41 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G50520
42 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ELIP; ELIP1
43 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  DiT1
44 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATCESA3
45 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATELP; ATELP1; ATVSR1; BP-80; BP80; BP80-1;1; BP80B; GFS1; VSR1; VSR1;1
46 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AUX1
47 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ALE2
48 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATAVP3; AtVHP1;1; AVP-3; AVP1
49 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  EDS5
50 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATMEMB12; MEMB12
51 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
52 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATVIT1; VIT1
53 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ABCG22; AtABCG22
54 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AtRLP30; RLP30
55 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G50290
56 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ABCI14; TGD1
57 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  PIN6
58 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G19570
59 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G52155
60 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G02380
61 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G13266
62 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G11810
63 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G15610
64 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G22830
65 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G13950
66 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G57345
67 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G56010
68 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT2G04360
69 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G62400
70 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G47420
71 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G23090
72 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  TET15
73 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AtSWEET5; AtVEX1; SWEET5
74 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  RTH
75 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  SVL4
76 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G46370
77 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G59730
78 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G74370
79 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G49230
80 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G29270
81 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G30660
82 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT2G29020
83 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G27210
84 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G27370
85 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G36820
86 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G03820
87 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT2G42770
88 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G52600
89 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G15710
90 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G53190
91 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G16620
92 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AtMGT3; AtMRS2-5; MGT3; MRS2-5
93 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATMGT9; MGT9; MRS2-2
94 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G08930
95 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G54320
96 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G35080
97 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G03730
98 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G28330
99 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G30080
100 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G14670
101 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT2G01970
102 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G22845
103 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G69460
104 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G07475
105 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AtENODL15; ENODL15
106 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  DAD2
107 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  PDLP8
108 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G68380
109 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G42370
110 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G16510
111 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G15500
112 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G51160
113 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AGP16; ATAGP16
114 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G26770
115 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G55330
116 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ABCG16
117 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ABCG10
118 AT3G46890  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G41800
119 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  ATGLR1.1; GLR1; GLR1.1
120 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  PIP1;4; PIP1E; TMP-C
121 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  NIP2;1; NLM4
122 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AAP3; ATAAP3
123 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT2G33250
124 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G75810
125 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G21940
126 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  TET6
127 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G44960
128 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT2G25310
129 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G62200
130 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  ATMLO9; MLO9
131 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT5G49130
132 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT5G60750
133 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  ABCG9
134 AT3G46890  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AATL2; ATLHT2; LHT2
135 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT5G03345
136 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G16170
137 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT3G29034
138 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT4; ATIPS2
139 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G14990
140 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT3G52070
141 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT4G40045
142 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  GAE5
143 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT2G32380
144 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G17080
145 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATRBL2; RBL2
146 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G25510
147 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT2G38330
148 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT4G01410
149 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G56710
150 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ABCI12
151 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT5G07340
152 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  BOR5
153 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT5G55380
154 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  RPT2a
155 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ELIP2
156 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  CDPK6
157 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATCAX11; CAX11
158 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATSK42; SK42
159 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  NPC3
160 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATL4; TL4
161 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATGUT1; GUT2; IRX10
162 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
163 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  At17.1
164 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
165 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT2G41190
166 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATCLC-C; CLC-C
167 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  NIP7;1; NLM6; NLM8
168 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  is a member of  --  ATPIN1 family27, coding gene
169 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  is regulated by  --  zeatin complex17
170 AT3G46890  --  interacts with  --  PIN4  --  is modified by  --  D6PK
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact