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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node FLC
Type: Protein GRN ID: np06065 Name: FLC
Annotation: FLC, FLF, AGL25 | K-box region and MADS-box transcription factor family protein
Gene Locus: AT5G10140
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family MADS-MIKC
Pathways: Gibberellins;  Brassinosteroids;  Abscisic acid;  Salicylic acid 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250476_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 FLC  --  interacts with  --  PFT1
3 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP
4 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1
5 FLC  --  interacts with  --  AGL16
6 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1
7 FLC  --  is regulated by  --  ABI5
8 FLC  --  is regulated by  --  AT3G48430
9 FLC  --  is regulated by  --  CBFS
10 FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67
11 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  MYC3
12 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A
13 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  MYC4
14 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AtbZIP; bZIP
15 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ATERF15
16 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104
17 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ATWRKY10; MINI3; WRKY10
18 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ORA59
19 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2
20 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT4G39070
21 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  PHL1
22 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  RRTF1
23 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT4G18450
24 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ATERF1
25 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT3G23230
26 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT3G23220
27 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2
28 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT4G34040
29 FLC  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT2G15530
30 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  ATJ; ATJ3; J3
31 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  ap1
32 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  AGL6
33 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  AGL21
34 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  AGL15
35 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  AGL9; SEP3
36 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  AGL2; SEP1
37 FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  CAL
38 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1  --  interacts with  --  PR1
39 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1  --  interacts with  --  FLD
40 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1  --  interacts with  --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2
41 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1  --  interacts with  --  GNR1; NIA1; NR1
42 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2
43 FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1  --  interacts with  --  CJD1
44 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL63; GOA
45 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL44; ANR1
46 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL17
47 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL12; XAL1
48 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL11; STK
49 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL5; SHP2
50 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL1; SHP1
51 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL53
52 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL42
53 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL24
54 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL14
55 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL4; SEP2
56 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AG
57 FLC  --  interacts with  --  AGL16  --  is the target gene of  --  ath-miR824
58 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  regulates the expression of   --  LFY
59 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  RID3
60 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  AT5G47590
61 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  AGL71
62 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  AGL19; GL19
63 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  AGL13
64 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  ful
65 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  AGL3; SEP4
66 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  AT2G24550
67 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  ARR14
68 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  TPR3
69 FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1  --  interacts with  --  TPR2
70 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABI4
71 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABF1 family47, transcription factor gene
72 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ATEM6; EM6; GEA6
73 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  AtWRKY2
74 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  sdir1
75 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  AFP1
76 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  ABI3
77 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  SNRK2-3 family52, coding gene
78 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR6
79 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR5
80 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR4
81 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  WRKY18
82 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  W-BOX
83 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  ATWRKY60; WRKY60
84 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is regulated by  --  HY5
85 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
86 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
87 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF3
88 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF1
89 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG1
90 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-3
91 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-2
92 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  HAI1
93 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  COR27
94 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  CIR1; RVE2
95 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AO
96 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCAD5; CAD-5; CAD5
97 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G23050
98 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G16670
99 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AT3G48510
100 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
101 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP2
102 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G10585
103 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATBZIP12; DPBF4; EEL
104 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ACS10
105 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  DRB1
106 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  CCH/CHLH/GUN5
107 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATGSK1; ATSK2-3; ATSK22; BIL2; GSK1; SK22
108 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ASKdZeta
109 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  FCA
110 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AtMYB49; MYB49
111 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  SSP4
112 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC072; RD26
113 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ABI1
114 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G25160
115 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATWNK2; WNK2; ZIK3
116 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
117 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-B11; PP2-B11
118 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  anac032; NAC032
119 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G76210
120 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-A5; PP2-A5
121 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC019; NAC019
122 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  RAP2.4
123 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  DCAF1
124 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  TAP46
125 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
126 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  interacts with  --  KEG
127 FLC  --  is regulated by  --  ABI5  --  is modified by  --  AT5G21326
128 FLC  --  is regulated by  --  AT3G48430  --  regulates the expression of   --  BES1
129 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  regulates the expression of   --  COR15A
130 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  is regulated by  --  FPA family, transcription factor gene
131 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  ATHDA5; HDA05; HDA5
132 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9
133 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  ATHDA15; HDA15
134 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  FVE
135 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  CO; FG
136 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
137 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  GI
138 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  FPA
139 FLC  --  is regulated by  --  CBFS  --  interacts with  --  FLK
140 FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67  --  interacts with  --  AT3G28715
141 FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67  --  interacts with  --  AT5G57860
142 FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67  --  interacts with  --  CYCA2;3
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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