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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AGL53
Type: Protein GRN ID: np36069 Name: AGL53
Annotation: AGL53 | AGAMOUS-like 53
Gene Locus: AT5G27070
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family MADS-type1
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AGL53  --  interacts with  --  AGL16
3 AGL53  --  interacts with  --  AGL6
4 AGL53  --  interacts with  --  AGL97
5 AGL53  --  interacts with  --  AT5G49420
6 AGL53  --  interacts with  --  AGL83
7 AGL53  --  interacts with  --  AT5G38620
8 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  FLC
9 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL22; SVP
10 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL63; GOA
11 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL44; ANR1
12 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL21
13 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL17
14 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL12; XAL1
15 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL11; STK
16 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  ap1
17 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL5; SHP2
18 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL1; SHP1
19 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL42
20 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL24
21 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  SOC1
22 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL15
23 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL14
24 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL9; SEP3
25 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL4; SEP2
26 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL2; SEP1
27 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AG
28 AGL53  --  interacts with  --  AGL16  --  is the target gene of  --  ath-miR824
29 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL92
30 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL86
31 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL78
32 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AT1G48150
33 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL66
34 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL39
35 AGL53  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  ful
36 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL26
37 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL104
38 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL103
39 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL101
40 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL90
41 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL89
42 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL87
43 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL82
44 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL77
45 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL76
46 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL65
47 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL62
48 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL52
49 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL43
50 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL37; PHE1
51 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  ABS; AGL32; TT16
52 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL27; FLM; MAF1
53 AGL53  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL3; SEP4
54 AGL53  --  interacts with  --  AGL83  --  interacts with  --  AGL54
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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