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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ABCB19/ATMDR1
Type: Protein GRN ID: np02048 Name: ABCB19/ATMDR1
Annotation: ATMDR1, ATMDR11, PGP19, MDR11, MDR1, ATPGP19, ABCB19, ATABCB19 | ATP binding cassette subfamily B19 [TCDB:1.A.8.10] [TCDB:1.A.8.12] [TCDB:1.A.8.16] [TCDB:1.A.8.8] [TCDB:4.A.1.2]
Gene Locus: AT3G28860
References:
  • Lewis DR, Miller ND, Splitt BL, Wu G, Spalding EP. Separating the roles of acropetal and basipetal auxin transport on gravitropism with mutations in two Arabidopsis multidrug resistance-like ABC transporter genes. Plant Cell. 2007 Jun;19(6):1838-50. Epub 2007 Jun 8. PubMed PMID: 17557805; PubMed Central PMCID: PMC1955737.
  • Wu G, Lewis DR, Spalding EP. Mutations in Arabidopsis multidrug resistance-like ABC transporters separate the roles of acropetal and basipetal auxin transport in lateral root development. Plant Cell. 2007 Jun;19(6):1826-37. Epub 2007 Jun 8. PubMed PMID: 17557807; PubMed Central PMCID: PMC1955722.
 
Pathways: Auxins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257137_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1
3 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240
4 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2
5 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710
6 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.92041) with  --  AT5G66310
7 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.33498) with  --  LNG1
8 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid
9 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Arsenite
10 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Silicon
11 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite
12 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Formamide
13 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol
14 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose
15 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea
16 ABCB19/ATMDR1  --  is a member of  --  ABCB1 family29, coding gene
17 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  interacts with  --  AT1G72390
18 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  interacts with  --  JK218; NPH3; RPT3
19 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  interacts with  --  PKS1
20 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.812801) with  --  ABCG32; ATPDR4; PDR4; PEC1
21 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.851155) with  --  AT2G18300
22 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.871448) with  --  AT1G52190
23 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.844) with  --  AT3G16370
24 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.801162) with  --  AT5G14410
25 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.83183) with  --  P1R1
26 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  modify  --  PKS4
27 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  modify  --  NPL1; PHOT2
28 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  modify  --  AT4G14480
29 ABCB19/ATMDR1  --  is modified by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1  --  modify  --  AHA1
30 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  AT1G22550
31 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  atgos11; GOS11
32 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  KAPP; RAG1
33 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  ACBK1; ATCNGC10; CNGC10
34 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  AT1G22570
35 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  AtRLP10; CLV2
36 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  PIN3
37 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  ATPUP5; PUP5
38 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
39 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  AT4G18220
40 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  KAT1
41 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  ATERDJ2A
42 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  ATUPS1; UPS1
43 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  ATSUC3; ATSUT2; SUC3; SUT2
44 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  AT5G15240  --  interacts with  --  GLT1; PGLCT
45 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ATMAPR3; ATMP2; MAPR3; MSBP2
46 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ABCI12
47 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  AT4G38690
48 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
49 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
50 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  CYP81D8
51 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ABR; PID
52 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  AHA2; HA2; PMA2
53 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ABCC2; AtABCC2; ATMRP2; EST4; MRP2
54 ABCB19/ATMDR1  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2  --  interacts with  --  ABCC1; ATABCC1; ATMRP1; EST1; MRP1
55 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.848393) with  --  AT2G38090
56 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.819618) with  --  AT1G12080
57 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880119) with  --  ATSFH3; SFH3
58 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03937) with  --  DRT100
59 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.869815) with  --  AFB1
60 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.830541) with  --  AT5G22310
61 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.87002) with  --  AT5G24580
62 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859834) with  --  AT3G12710  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17968) with  --  AT5G48900
63 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.92041) with  --  AT5G66310  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.844853) with  --  ATMLO4; MLO4
64 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.92041) with  --  AT5G66310  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.886073) with  --  BEN1
65 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.33498) with  --  LNG1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.851641) with  --  ATCRR2; CCR2
66 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.33498) with  --  LNG1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.897847) with  --  AtHB23; HB23
67 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.33498) with  --  LNG1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.92488) with  --  AtENODL8; ENODL8
68 ABCB19/ATMDR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.33498) with  --  LNG1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.826008) with  --  AT5G12940
69 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA5; ATATH4; ATH4
70 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA4; ATATH3
71 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA3; ATATH2; ATH2
72 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA2; ATATH1; ATH1
73 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  TIP5;1
74 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ATPS3; PS3
75 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  PHT4;3
76 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ATUTR5; UTR5
77 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G30390
78 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G28960
79 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G28080
80 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  PHT3;1
81 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ZIFL1
82 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ZIF1
83 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT5G13670
84 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ABCG6
85 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  SULTR4;1
86 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  KEG
87 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AAC2
88 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT4G01440
89 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  EDA13; EDA19; SWA1
90 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G46520
91 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G44920
92 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  TPR15
93 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ER; QRP1
94 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G23780
95 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G21120
96 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Formamide  --  has product (in catalytic reaction)  --  Formate
97 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  AT3G28130
98 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  AT3G28100
99 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  has product (in catalytic reaction)  --  sn-Glycerol 3-phosphate
100 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45720
101 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45710
102 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45700
103 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45690
104 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45680
105 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45660
106 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  NAXT1
107 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATNRT2.6; NRT2.6
108 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX10; CHX10
109 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX11; CHX11
110 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX12; CHX12
111 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX4; CHX4
112 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ZIFL2
113 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AHA8; HA8
114 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G30340
115 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  SCM; SRF9; SUB
116 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  has product (in catalytic reaction)  --  Raffinose
117 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  has product (in catalytic reaction)  --  myo-Inositol
118 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS2; SSA; SUS2
119 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  D-Fructose
120 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  NDP-glucose
121 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS5; SUS5
122 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ASUS1; atsus1; SUS1
123 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS3; SUS3
124 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS4; SUS4
125 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS6; SUS6
126 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ATCNGC1; CNGC1
127 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G53010
128 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ABCG8
129 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G52450
130 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  HCF106
131 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G52050
132 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ATKEA5; KEA5
133 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G51160
134 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G51050
135 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G50140
136 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G49990
137 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AKR4C8
138 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
139 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  HSP70T-2
140 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  PR1
141 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT2G07718
142 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  RIE1
143 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08900
144 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Arginine
145 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08870
146 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
147 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  GONST5
148 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT1G21070
149 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
150 ABCB19/ATMDR1  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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