Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT2G42030
Type: Protein GRN ID: np19645 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein [TCDB:3.A.1.10] [TCDB:3.A.1.110] [TCDB:3.A.1.112] [TCDB:3.A.1.119] [TCDB:3.A.1.15] [TCDB:3.A.1.201] [TCDB:3.A.1.210] [TCDB:3.A.1.26] [TCDB:3.A.1.6]
Gene Locus: AT2G42030
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 267539_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT2G42030  --  transport  --  5'-Hydroxystreptomycin
3 AT2G42030  --  transport  --  ortho-Vanadate
4 AT2G42030  --  transport  --  Oxacillin
5 AT2G42030  --  transport  --  Oxytetracycline
6 AT2G42030  --  transport  --  Tetracycline
7 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate
8 AT2G42030  --  transport  --  Streptomycin
9 AT2G42030  --  transport  --  Thiosulfate
10 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate
11 AT2G42030  --  transport  --  5'-Hydroxystreptomycin  --  is transported by  --  ATP3
12 AT2G42030  --  transport  --  5'-Hydroxystreptomycin  --  is transported by  --  AT2G30940
13 AT2G42030  --  transport  --  5'-Hydroxystreptomycin  --  is transported by  --  AT2G02370
14 AT2G42030  --  transport  --  ortho-Vanadate  --  is transported by  --  ftsh4
15 AT2G42030  --  transport  --  ortho-Vanadate  --  is transported by  --  ATXIG; XIG
16 AT2G42030  --  transport  --  Tetracycline  --  is transported by  --  BAN
17 AT2G42030  --  transport  --  Tetracycline  --  is transported by  --  IQD30
18 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Molybdoenzyme molybdenum cofactor
19 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G65240
20 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G56720
21 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G54150
22 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G51900
23 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  RHS6
24 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G51790
25 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  ATSERK2; SERK2
26 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G26690
27 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
28 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G22700
29 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  BIP3
30 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  iam hyd
31 AT2G42030  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  PEX6
32 AT2G42030  --  transport  --  Thiosulfate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Thiocyanate
33 AT2G42030  --  transport  --  Thiosulfate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Sulfite
34 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Adenylyl sulfate
35 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT-SO; AtSO; SOX
36 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ACA8; AT-ACA8
37 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  PM-ANT
38 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATOPT1; OPT1
39 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATOPT9; OPT9
40 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ACBP; ACBP1
41 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT4G01440
42 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AKR4C8
43 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  HSP70T-2
44 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AtJ8; AtToc12; J8; Toc12
45 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G80870
46 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  PDE318
47 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  TPR12
48 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G65090
49 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  4CL3
50 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AtHrd1B; Hrd1B
51 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  SC3
52 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G51940
53 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G51930
54 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G44960
55 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G33910
56 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G33900
57 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G31250
58 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G21540
59 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G21530
60 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G18320
61 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATLAC1; LAC1
62 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATTIM23-1; TIM23-1
63 AT2G42030  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  MEE4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact