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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G40810
Type: Protein GRN ID: np38184 Name:
Annotation: Cytochrome C1 family [TCDB:2.A.18.2] [TCDB:2.A.18.6] [TCDB:2.A.18.7]
Gene Locus: AT5G40810
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 249324_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine
3 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine
4 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine
5 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine
6 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine
7 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine
8 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Isoleucyl-tRNA(Ile)
9 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
10 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
11 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  NAD7
12 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  NAD6
13 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  COB
14 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  APE2; TPT
15 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  ATPTR3; PTR3
16 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  AT5G46040
17 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  HMA7; RAN1
18 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  PHT4;6
19 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  ALA2
20 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  ABCI21; ATNAP2; ATPOP1; POP1
21 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  AT5G44050
22 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  ATSUC6; SUC6
23 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  APT1; PHT1;2; PHT2
24 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  AT5G11230
25 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  GONST5
26 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  AT1G21070
27 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
28 AT5G40810  --  transport  --  L-Isoleucine  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
29 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Threonyl-tRNA(Thr)
30 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  has product (in catalytic reaction)  --  2-Oxobutanoate
31 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Acetaldehyde
32 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  MTO2; TS
33 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  O-Phospho-L-homoserine
34 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT1G72810
35 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  AT5G45450
36 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  ATDUR3; DUR3
37 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  AT5G45370
38 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  ZIP8
39 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  AtMfl1; Mfl1
40 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  AT5G41800
41 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  LHT1
42 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  LAX3
43 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  ATPTR5; PTR5
44 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  ABCD1; ACN2; AtABCD1; CTS; PED3; PXA1
45 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  AT1G21890
46 AT5G40810  --  transport  --  L-Threonine  --  is transported by  --  PHT1;8
47 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Asparaginyl-tRNA(Asn)
48 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ASN2
49 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ASN3
50 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ASN1; AT-ASN1; DIN6
51 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AtNIT4; NIT4
52 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  3-Cyano-L-alanine
53 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is transported by  --  AT5G41760
54 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is transported by  --  MDAR6
55 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
56 AT5G40810  --  transport  --  L-Asparagine  --  is transported by  --  AT1G14820
57 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Leucyl-tRNA
58 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  has product (in catalytic reaction)  --  4-Methyl-2-oxopentanoate
59 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  COX1
60 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
61 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  ORF291
62 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
63 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
64 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD3
65 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD4L
66 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD4
67 AT5G40810  --  transport  --  L-Leucine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.1; NAD2A
68 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Tyrosyl-tRNA(Tyr)
69 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Tyramine
70 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-(4-Hydroxyphenyl)pyruvate
71 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G34930
72 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Arogenate
73 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT1G15710
74 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT1G04420
75 AT5G40810  --  transport  --  Tyrosine  --  is transported by  --  AT1G03550
76 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Methionyl-tRNA
77 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  2-Aminobut-2-enoate
78 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Methanethiol
79 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  S-Methyl-L-methionine
80 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  L-Methionine (S)-S-oxide
81 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Thioredoxin
82 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Peptide-L-methionine (S)-S-oxide
83 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G08415
84 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Protein N6-(octanoyl)lysine
85 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  LIP1
86 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  BIO2; BIOB
87 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Dethiobiotin
88 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATMS3; MS3
89 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Homocysteine
90 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  5-Methyltetrahydropteroyltri-L-glutamate
91 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATCIMS; ATMETS; ATMS1
92 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATMS2; MS2
93 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMT-2; HMT-2; HMT2
94 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMT-1; HMT-1
95 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  HMT3
96 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G63290
97 AT5G40810  --  transport  --  L-Methionine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Coproporphyrinogen III
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

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