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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node CBFS
Type: Protein GRN ID: np06066 Name: CBFS
Annotation: HOS1 | ubiquitin-protein ligases [EC:6.3.2.19]
Gene Locus: AT2G39810
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Pathways: Gibberellins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245120_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 CBFS  --  interacts with  --  ATHDA5; HDA05; HDA5
3 CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9
4 CBFS  --  interacts with  --  ATHDA15; HDA15
5 CBFS  --  interacts with  --  FVE
6 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG
7 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
8 CBFS  --  interacts with  --  GI
9 CBFS  --  interacts with  --  FPA
10 CBFS  --  interacts with  --  FLK
11 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC
12 CBFS  --  regulates the expression of   --  COR15A
13 CBFS  --  is regulated by  --  FPA family, transcription factor gene
14 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1
15 CBFS  --  interacts with  --  ATHDA5; HDA05; HDA5  --  interacts with  --  14-3-3EPSILON
16 CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9  --  interacts with  --  AT1G19330
17 CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9  --  interacts with  --  AT1G75060
18 CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9  --  interacts with  --  AHL22
19 CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.866353) with  --  hda10
20 CBFS  --  interacts with  --  HDA09; HDA9  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.866353) with  --  hda17
21 CBFS  --  interacts with  --  ATHDA15; HDA15  --  interacts with  --  PIF3
22 CBFS  --  interacts with  --  ATHDA15; HDA15  --  is the target gene of  --  ath-miR780.1
23 CBFS  --  interacts with  --  FVE  --  interacts with  --  MSI5; NFC5
24 CBFS  --  interacts with  --  FVE  --  interacts with  --  AT2G42940
25 CBFS  --  interacts with  --  FVE  --  interacts with  --  DDB1B
26 CBFS  --  interacts with  --  FVE  --  interacts with  --  DDB1A
27 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  regulates the expression of   --  FT?
28 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  regulates the expression of   --  OBF4
29 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  is regulated by  --  CDF1
30 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP2B; HAP2B; NF-YA2; UNE8
31 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YC3
32 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT5G65683
33 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AS1
34 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  COP1
35 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ADO2; LKP2
36 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YB2
37 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
38 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  HAP5C; NF-YC9
39 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5B; HAP5B; NF-YC2
40 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5A; HAP5A; NF-YC1
41 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATSWI3B?
42 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT1G72390
43 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT3G18380
44 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  OBE1
45 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ABI3
46 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA4
47 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA3
48 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA2
49 CBFS  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA1
50 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  RGE1; ZOU
51 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  SNRK2-3
52 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  JAZ11
53 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  JAZ9
54 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  JAZ4
55 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  JAI3
56 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  JAZ1
57 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  ATMYB15; ATY19; MYB15
58 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  HHP1
59 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  FMA
60 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  MUTE
61 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  interacts with  --  SPCH
62 CBFS  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM  --  regulates the expression of   --  CBF3
63 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ATSOS3; CBL4; SOS3
64 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ATSOS2; CIPK24; SNRK3.11; SOS2
65 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  SPY
66 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
67 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
68 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ELF3; PYK20
69 CBFS  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  SPL11
70 CBFS  --  interacts with  --  FPA  --  interacts with  --  AT2G25280
71 CBFS  --  interacts with  --  FPA  --  interacts with  --  ATMEK4; ATMKK4; MKK4
72 CBFS  --  interacts with  --  FPA  --  interacts with  --  AT1G77400
73 CBFS  --  interacts with  --  FLK  --  interacts with  --  PEP
74 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  interacts with  --  PFT1
75 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP
76 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  interacts with  --  ATSIZ1
77 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  interacts with  --  AGL16
78 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  is regulated by  --  ABI5
79 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  is regulated by  --  AT3G48430
80 CBFS  --  regulates the expression of   --  FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67
81 CBFS  --  regulates the expression of   --  COR15A  --  interacts with  --  CERK1; LYSM RLK1
82 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  regulates the expression of   --  LFY
83 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL2; SEP1
84 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  RID3
85 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AT5G47590
86 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL71
87 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL44; ANR1
88 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL42
89 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL19; GL19
90 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL17
91 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL14
92 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL13
93 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL12; XAL1
94 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  CAL
95 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  ful
96 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  ap1
97 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL6
98 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL5; SHP2
99 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL4; SEP2
100 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL3; SEP4
101 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL1; SHP1
102 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AT2G24550
103 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  ARR14
104 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  TPR3
105 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  TPR2
106 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL24
107 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL21
108 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL15
109 CBFS  --  is regulated by  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL9; SEP3
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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