Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ABF1
Type: Protein GRN ID: np03041 Name: ABF1
Annotation: ABF1 | abscisic acid responsive element-binding factor 1
Gene Locus: AT1G49720
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family bZIP
References:
  • Finkelstein RR, Gampala SS, Rock CD. Abscisic acid signaling in seeds and seedlings. Plant Cell. 2002;14 Suppl:S15-45. Review. PubMed PMID: 12045268; PubMed Central PMCID: PMC151246.
 
Pathways: Abscisic acid 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 261613_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ABF1  --  is modified by  --  CPK4
3 ABF1  --  interacts with  --  ABF3
4 ABF1  --  interacts with  --  ABI5
5 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
6 ABF1  --  interacts with  --  AHG1
7 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
8 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3
9 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-2
10 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1
11 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32
12 ABF1  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
13 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2
14 ABF1  --  interacts with  --  ABF2/AREB1
15 ABF1  --  interacts with  --  KEG
16 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK9; ATCPK12; CDPK9; CPK12
17 ABF1  --  is a member of  --  ABF1 family47, transcription factor gene
18 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  FD
19 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  ATHSP93-V; CLPC; CLPC1; DCA1; HSP93-V
20 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  iqd2
21 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  Phox4
22 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  HCEF1
23 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  ABCG15
24 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  ATEHD1; EHD1
25 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  AT3G11960
26 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  AT2G36420
27 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  KCS11
28 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  AT1G02410
29 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  AT5G43210
30 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  SEC5A
31 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  AT3G42800
32 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  MANIA; MNS2
33 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  GAE6
34 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  interacts with  --  AT5G21940
35 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  transport  --  Nickel(2+)
36 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  transport  --  Silver
37 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  transport  --  Lead
38 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  transport  --  Mercury(2+)
39 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  transport  --  Cu2+
40 ABF1  --  is modified by  --  CPK4  --  transport  --  Zinc cation
41 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  ABI1
42 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  AtERF48; DREB2C
43 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  AT3G48510
44 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
45 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  AFP2
46 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  AT1G10585
47 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  interacts with  --  14-3-3PHI
48 ABF1  --  interacts with  --  ABF3  --  is modified by  --  SNRK2-8; SNRK2.8; SRK2C
49 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABI4
50 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  FLC
51 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ATEM6; EM6; GEA6
52 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AtWRKY2
53 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  sdir1
54 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AFP1
55 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ABI3
56 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  SNRK2-3 family52, coding gene
57 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR6
58 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR5
59 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR4
60 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  WRKY18
61 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  W-BOX
62 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ATWRKY60; WRKY60
63 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  HY5
64 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  HAI1
65 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  COR27
66 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CIR1; RVE2
67 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AO
68 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCAD5; CAD-5; CAD5
69 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G23050
70 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G16670
71 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATBZIP12; DPBF4; EEL
72 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ACS10
73 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DRB1
74 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CCH/CHLH/GUN5
75 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATGSK1; ATSK2-3; ATSK22; BIL2; GSK1; SK22
76 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ASKdZeta
77 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  FCA
78 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtMYB49; MYB49
79 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SSP4
80 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC072; RD26
81 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G25160
82 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATWNK2; WNK2; ZIK3
83 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
84 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-B11; PP2-B11
85 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  anac032; NAC032
86 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G76210
87 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-A5; PP2-A5
88 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC019; NAC019
89 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  RAP2.4
90 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DCAF1
91 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  TAP46
92 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
93 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATSIZ1
94 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  PFT1
95 ABF1  --  interacts with  --  ABI5  --  is modified by  --  AT5G21326
96 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  SLAC1 CDI3
97 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL3; RCAR13
98 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL6; RCAR9
99 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL5; RCAR8
100 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL13; RCAR7
101 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL12; RCAR6
102 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL11; RCAR5
103 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL10; RCAR4
104 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL7; RCAR2
105 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  pyl9
106 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  pyl8
107 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  AT5G51190
108 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  ATHVA22D; HVA22D
109 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYR1
110 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL4
111 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  CIPK11; PKS5; SIP4; SNRK3.22
112 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  ZW9
113 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  CBL7
114 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  CBL5
115 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  ATCBL3; CBL3
116 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  ATCBL2; CBL2
117 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  ATCBL1
118 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  CIPK1; SnRK3.16
119 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  ATCIPK6; CIPK6; SIP3; SNRK3.14
120 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  AKT2
121 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL2
122 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  interacts with  --  PYL1
123 ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca  --  is a member of  --  ABI1 family46, coding gene
124 ABF1  --  interacts with  --  AHG1  --  interacts with  --  CIPK16; SnRK3.18
125 ABF1  --  interacts with  --  AHG1  --  interacts with  --  ATCRR2; CCR2
126 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  CPK24
127 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATDI19; DI19
128 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G41670
129 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G27850
130 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G27760
131 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  IQD24
132 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATCPL1; CPL1; FRY2
133 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  NAGS1
134 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT2G32750
135 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT1G25550
136 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  PIN7
137 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AtHB32; HB32; ZHD14
138 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT3G22530
139 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  PSB29; THF1
140 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  mtACP2
141 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATTOC33; PPI1; TOC33
142 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ADF3
143 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  UCH2
144 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT1G74470
145 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  HSP1
146 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATBT2; BT2
147 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT5G52550
148 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  AT3G26510
149 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23
150 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATWRKY8; WRKY8
151 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATRBOH D
152 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATRBOH F
153 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATWRKY28; WRKY28
154 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATWRKY48; WRKY48
155 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  modify  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
156 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  transport  --  Sterol
157 ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11  --  is a member of  --  ATCDPK3 CPK4 CDPK6 ATCDPK2 CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 cpk21, coding gene
158 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  interacts with  --  ABI2
159 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  interacts with  --  HAB1
160 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
161 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.862906) with  --  AT1G17145
162 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.822226) with  --  BAM4; BMY6
163 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  modify  --  AREB3; DPBF3
164 ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3  --  is a member of  --  SNRK2-3 family45, coding gene
165 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A
166 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1
167 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1
168 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1
169 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2
170 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820
171 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6
172 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5
173 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  transport  --  5-FU
174 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  transport  --  Allantoin
175 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  transport  --  Xanthine
176 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  transport  --  Urate
177 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  transport  --  Uracil
178 ABF1  --  interacts with  --  ATSERK1  --  is a member of  --  BAK1 family4, coding gene
179 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  interacts with  --  ATCNGC18; CNGC18
180 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.866051) with  --  ANAC062; NAC062; NTL6
181 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  At-RSZ22a; RSZ22a
182 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  SAPX
183 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  AT1G80850
184 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  CLE41
185 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  AT2G37100
186 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  AT2G16810
187 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  WOX11
188 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  AT4G26950
189 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  ATMES11; MES11
190 ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32  --  modify  --  ATGH9A2; KOR2
191 ABF1  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2  --  interacts with  --  ASK1
192 ABF1  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2  --  interacts with  --  TPR2
193 ABF1  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
194 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  interacts with  --  CBF3
195 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A
196 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  interacts with  --  ATHB21; HB-2; HB21
197 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  interacts with  --  AT3G23220
198 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  interacts with  --  ATCDPK1/CPK10
199 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  interacts with  --  FT?
200 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  regulates the expression of   --  CYTC-2
201 ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.80391) with  --  AT3G16940
202 ABF1  --  interacts with  --  ABF2/AREB1  --  regulates the expression of   --  COR78; LTI140; LTI78; RD29A
203 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  interacts with  --  ATEDR1; EDR1
204 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.818022) with  --  AT4G30100
205 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.818022) with  --  AT2G19120
206 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Sugar
207 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Selenite
208 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Dopamine
209 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Dicarboxylate
210 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Betaine
211 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Aromatic acid
212 ABF1  --  interacts with  --  KEG  --  transport  --  Citrate
213 ABF1  --  is a member of  --  ABF1 family47, transcription factor gene  --  is regulated by  --  ATMYB44
214 ABF1  --  is a member of  --  ABF1 family47, transcription factor gene  --  is regulated by  --  AtWRKY63
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact