Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node BHLH42; TT8
Type: Protein GRN ID: np30737 Name: BHLH42; TT8
Annotation: TT8, BHLH42 | basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
Gene Locus: AT4G09820
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family bHLH
Pathways: Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 255056_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB63; MYB63
3 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB4; MYB4
4 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB5; MYB5
5 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB114; MYB114
6 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113
7 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1
8 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2
9 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23
10 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB123; ATTT2; MYB123; TT2
11 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?
12 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11
13 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ10
14 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9
15 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ8
16 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ6
17 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ5
18 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ2
19 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1
20 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB63; MYB63  --  regulates the expression of   --  4CL.1; 4CL1; AT4CL1
21 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB63; MYB63  --  is the target gene of  --  ath-miR858b
22 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB63; MYB63  --  is the target gene of  --  ath-miR858a
23 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB4; MYB4  --  interacts with  --  AT4G25920
24 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB4; MYB4  --  interacts with  --  ATMYC1; myc1
25 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB5; MYB5  --  interacts with  --  ATMYC-2; EGL1; EGL3
26 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB114; MYB114  --  interacts with  --  TCP3
27 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.930768) with  --  AT2G22950
28 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.985829) with  --  AT2G07070
29 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.920381) with  --  AT2G05600
30 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.919824) with  --  PRA1.G1
31 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.822822) with  --  AT1G78840
32 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.930696) with  --  AT2G33260
33 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.818028) with  --  AT3G42300
34 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.04865) with  --  AT3G42770
35 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02205) with  --  AT3G49480
36 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.933944) with  --  AT5G10420
37 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.996129) with  --  AT5G47130
38 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.967218) with  --  AT5G54220
39 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  AtMYB113; MYB113  --  is the target gene of  --  ath-miR828
40 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  regulates the expression of   --  ATCHS; CHS; TT4
41 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  regulates the expression of   --  ATFLS1; FLS; FLS1
42 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  regulates the expression of   --  CHI
43 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  is regulated by  --  ATMYB12; MYB12; PFG1
44 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA4
45 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA3
46 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA2
47 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA1
48 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  GL3; GL3; MYC6.2
49 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  AT5G62710
50 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  AT4G37130
51 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  TT1; WIP1
52 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
53 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2  --  interacts with  --  COP1
54 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATMYB123; ATTT2; MYB123; TT2  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
55 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
56 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARF3
57 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G50680
58 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  TCP16
59 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
60 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
61 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
62 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
63 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
64 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
65 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
66 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
67 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
68 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
69 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
70 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
71 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
72 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  KNAT3
73 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
74 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
75 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  anac032; NAC032
76 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
77 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
78 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
79 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
80 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
81 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
82 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
83 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
84 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
85 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
86 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
87 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
88 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
89 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
90 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
91 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
92 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
93 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
94 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
95 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
96 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
97 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
98 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
99 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
100 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
101 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
102 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
103 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
104 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  OBF4
105 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
106 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
107 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
108 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
109 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CO; FG
110 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  FCA
111 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
112 BHLH42; TT8  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BSH; CHE1
113 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  regulates the expression of   --  ATGL1; ATMYB0; GL1; MYB0
114 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  AT4G00870
115 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  AT4G16430
116 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  AIB; ATAIB
117 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  AT1G01260
118 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  MYC4
119 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  MYC3
120 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  AtMYB24; MYB24
121 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  ATMYB21; ATMYB3; MYB21
122 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
123 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ11  --  is a member of  --  JAI3 family107, transcription factor gene
124 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  BIM3
125 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  BIM1
126 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  BIM2
127 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  NINJA
128 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  COI1
129 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  regulates the expression of   --  AT5G53080
130 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  interacts with  --  JAI3
131 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  interacts with  --  JAZ4
132 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  interacts with  --  RGA1
133 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  interacts with  --  AT3G27960
134 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  interacts with  --  LSU1
135 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ9  --  interacts with  --  ICE2; SCRM2
136 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ8  --  interacts with  --  ATWRKY57; WRKY57
137 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ6  --  interacts with  --  TPR3
138 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ6  --  interacts with  --  TPR1
139 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ6  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
140 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ5  --  regulates the expression of   --  TPR3
141 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ5  --  regulates the expression of   --  AtTPR2; TPR2
142 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.804837) with  --  OPCL1
143 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  RGL3
144 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  RGL2
145 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  RGL
146 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  EIL1
147 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  AT3G14080
148 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  LSU2
149 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  AT3G11830
150 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  AT5G14260
151 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  EIN3
152 BHLH42; TT8  --  is regulated by  --  JAZ1  --  is a member of  --  jaz complexes
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact