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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G25560
Type: Protein GRN ID: np05043 Name: AT1G25560
Annotation: TEM1, EDF1 | AP2/B3 transcription factor family protein
Gene Locus: AT1G25560
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family RAV
Pathways: Ethylene 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 255742_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
3 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3
4 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2
5 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1
6 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene
7 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AtMYB98; MYB98
8 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT3G21890
9 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TCP8
10 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G51120
11 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT-HSFB2B; HSFB2B
12 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA19
13 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AP2; FL1; FLO2
14 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  SPL1
15 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  RAV1
16 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  bZIP23
17 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ATBZIP9; BZIP9; BZO2H2
18 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TOE2
19 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF17
20 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA2
21 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA10
22 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
23 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT5G42530
24 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF18
25 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF9
26 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF2/ARF1-BP
27 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  JAZ6
28 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G30810
29 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  FRS3
30 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ATZFP11; ZFP11
31 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  STZ; ZAT10
32 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT-HSFB1; ATHSF4; HSF4; HSFB1
33 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  EPR1; RVE7
34 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ASL39; LBD37
35 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  LBD41
36 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  NZZ; SPL
37 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  transport  --  Sterol
38 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G63350
39 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BBM
40 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G16350
41 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR2
42 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATWRKY30; WRKY30
43 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB15; ATY19; MYB15
44 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB20; MYB20
45 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYBL2; MYBL2
46 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BZIP45
47 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB97; MYB97
48 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G35560
49 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP16
50 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ANAC055; ATNAC3; NAC055; NAC3
51 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G38300
52 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF12
53 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  HAT1
54 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT4G35610
55 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP3
56 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  anac074; NAC074
57 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G33550
58 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G68670
59 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA13
60 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB73; MYB73
61 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  SOC1
62 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
63 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB3R2; MYB3R-2; MYB3R2; PC-MYB2
64 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA11
65 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR5
66 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G14970
67 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARI1; ATARI1
68 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G44630
69 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  EMF1
70 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BEH4
71 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATTKL; TKL
72 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G55040
73 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR3
74 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  JAZ5
75 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB44
76 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB32; MYB32
77 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB7; ATY49; MYB7
78 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-8
79 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-7
80 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-4
81 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF3
82 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
83 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA3
84 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G25550
85 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
86 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATWRKY6; WRKY6
87 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  OBF5
88 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G50680
89 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  GATA16
90 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
91 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ZFP4
92 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RVE1
93 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATZFP10; ZFP10
94 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AGL15
95 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AS1
96 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  CHR4; PKR1
97 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA8
98 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
99 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.846075) with  --  GTE4
100 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATWRKY32; WRKY32
101 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  GATA9
102 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  CBF4; DREB1D
103 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  bZIP21; TGA9
104 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  NF-YC4
105 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT4G03250
106 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT3G12730
107 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATWRKY61; WRKY61
108 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  anac096; NAC096
109 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G80610
110 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G12120
111 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT4G32030
112 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATSUMO3; SUM3; SUMO 3; SUMO3
113 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
114 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT2G36080
115 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  IAA18
116 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  GATA18; HAN; MNP
117 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  MYB77
118 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATERF11
119 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  is regulated by  --  JAI3
120 AT1G25560  --  interacts with  --  TPR1  --  is the target gene of  --  ath-miR5024-3p
121 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  porA
122 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  FLS2
123 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  PORB
124 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  Family84, coding gene
125 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  Family85, transcription factor gene
126 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  interacts with  --  Family90, coding gene
127 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  interacts with  --  Family89, coding gene
128 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  has family member  --  EIL3
129 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  has family member  --  EIL1
130 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  has family member  --  EIL2
131 AT1G25560  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene  --  has family member  --  EIN3
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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