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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATERF1
Type: Protein GRN ID: np05027 Name: ATERF1
Annotation: ERF1, ATERF1 | ethylene response factor 1
Gene Locus: AT3G23240
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family AP2-EREBP
References:
  • Solano R, Stepanova A, Chao Q, Ecker JR. Nuclear events in ethylene signaling: a transcriptional cascade mediated by ETHYLENE-INSENSITIVE3 and ETHYLENE-RESPONSE-FACTOR1. Genes Dev. 1998 Dec 1;12(23):3703-14. PubMed PMID: 9851977; PubMed Central PMCID: PMC317251.
 
Pathways: Ethylene;  Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257927_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6
3 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1
4 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1
5 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PR1 family109, coding gene
6 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77
7 ATERF1  --  regulates the expression of   --  ATHCHIB; B-CHI; CHI-B; HCHIB; PR-3; PR3
8 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3
9 ATERF1  --  is a member of  --  AtMYC2 family108, transcription factor gene
10 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene
11 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G21940
12 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  SKS1
13 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G29020
14 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39360
15 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G29250
16 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G16980
17 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ADF1; atadf; ATADF1
18 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  KAB1; KV-BETA1
19 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
20 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  HMGB5; HMGD; NFD05; NFD5
21 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39050
22 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ORP2A
23 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  APX3
24 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  PIN4
25 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G47530
26 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  SLAC1 CDI3
27 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATF2KP; F2KP; FKFBP
28 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
29 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT-HSFB2A; HSFB2A
30 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G15260
31 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  PAPP2C
32 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  OMTF3
33 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT4G17720
34 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  SS2
35 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC1; VDAC1
36 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC2; VDAC2
37 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ADH; ADH1; ATADH; ATADH1
38 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT-P4H-2
39 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  14-3-3OMEGA
40 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  FIP1
41 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G07340
42 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATHOL3; HOL3
43 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  GF14 UPSILON; GRF5
44 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  CHA19; CHR19; ETL1
45 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATRNS1; RNS1
46 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATRAB7B; ATRABG3F; RAB71; RAB7B; RAB7B; RABG3F
47 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G19440
48 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G02750
49 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  GRF3; RCI1
50 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1a; CRT1; CRT1a
51 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1b; CRT1b
52 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT1G53070
53 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G18240
54 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT2G45820
55 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATGSTF10; ATGSTF4; ERD13; GSTF10
56 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
57 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
58 ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6  --  is a member of  --  ATCDPK3 CPK4 CDPK6 ATCDPK2 CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 cpk21, coding gene
59 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ABI5
60 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A
61 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AtbZIP; bZIP
62 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ATERF15
63 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104
64 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  ATWRKY10; MINI3; WRKY10
65 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT4G39070
66 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  PHL1
67 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  RRTF1
68 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT4G18450
69 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT3G23230
70 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2
71 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  FLC
72 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT4G34040
73 ATERF1  --  interacts with  --  PFT1  --  interacts with  --  AT2G15530
74 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  CBF3
75 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAV1
76 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATERF-4
77 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM6; BPM6
78 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM5; BPM5
79 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM3; BPM3
80 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATCUL3B; CUL3B
81 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATCUL3; ATCUL3A; CUL3; CUL3A
82 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAP2.4; WIND1
83 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAP2.4
84 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATMYB69; MYB69
85 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  AtMYB56; MYB56
86 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ASML1; ATWRI1; WRI; WRI1
87 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.84123) with  --  AT3G48760
88 ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808783) with  --  AT5G44080
89 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PR1 family109, coding gene  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1
90 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PR1 family109, coding gene  --  is regulated by  --  ATMYC2
91 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PR1 family109, coding gene  --  has family member  --  PR2
92 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PR1 family109, coding gene  --  has family member  --  PR1
93 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77  --  interacts with  --  GRX480; roxy19
94 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77  --  interacts with  --  FAB2; SSI2
95 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77  --  is regulated by  --  OCP3
96 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77  --  is regulated by  --  ATWRKY70
97 ATERF1  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77  --  is regulated by  --  ORA59
98 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  Family84, coding gene
99 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  EBF1
100 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  ATERF11
101 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  ATERF13
102 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  AT3G23220
103 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  EBF2
104 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  is regulated by  --  JAI3 family107, transcription factor gene
105 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  is regulated by  --  CAMTA3; SR1
106 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  interacts with  --  MYC4
107 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  interacts with  --  MYC3
108 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  interacts with  --  JAZ1
109 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  interacts with  --  ATBHLH029; ATBHLH29; ATFIT1; BHLH029; FIT1; FRU
110 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  is a member of  --  Family83, transcription factor gene
111 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.812862) with  --  AT3G63500
112 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  is modified by  --  CTR1
113 ATERF1  --  is regulated by  --  EIN3  --  is modified by  --  ATMKK9
114 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATCHS; CHS; TT4
115 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATFLS1; FLS; FLS1
116 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATMYB12; MYB12; PFG1
117 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  Family86, transcription factor gene
118 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-2
119 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-7
120 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF6
121 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-8
122 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF10
123 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-5
124 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF12
125 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF3
126 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ERF104
127 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-9
128 ATERF1  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF14
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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