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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node RAV1
Type: Protein GRN ID: np01030 Name: RAV1
Annotation: RAV1, EDF4 | related to ABI3/VP1 1
Gene Locus: AT1G13260
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family RAV
References:
  • Hu YX, Wang YX, Liu XF, Li JY. Arabidopsis RAV1 is down-regulated by brassinosteroid and may act as a negative regulator during plant development. Cell Res. 2004 Feb;14(1):8-15. PubMed PMID: 15040885.
 
Pathways: Brassinosteroids 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 259364_at    
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1
3 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
4 RAV1  --  interacts with  --  TPR3
5 RAV1  --  interacts with  --  TPR2
6 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATERF1
7 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  CBF3
8 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATERF-4
9 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM6; BPM6
10 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM5; BPM5
11 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM3; BPM3
12 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATCUL3B; CUL3B
13 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATCUL3; ATCUL3A; CUL3; CUL3A
14 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAP2.4; WIND1
15 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAP2.4
16 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATMYB69; MYB69
17 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  AtMYB56; MYB56
18 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ASML1; ATWRI1; WRI; WRI1
19 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.84123) with  --  AT3G48760
20 RAV1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808783) with  --  AT5G44080
21 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AtMYB98; MYB98
22 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT3G21890
23 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TCP8
24 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G51120
25 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT-HSFB2B; HSFB2B
26 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA19
27 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AP2; FL1; FLO2
28 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  SPL1
29 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  bZIP23
30 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ATBZIP9; BZIP9; BZO2H2
31 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TOE2
32 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF17
33 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA2
34 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  IAA10
35 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
36 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT5G42530
37 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  TPR1
38 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF18
39 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF9
40 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ARF2/ARF1-BP
41 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  JAZ6
42 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G30810
43 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  FRS3
44 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ATZFP11; ZFP11
45 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  STZ; ZAT10
46 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT-HSFB1; ATHSF4; HSF4; HSFB1
47 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  AT1G25560
48 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  EPR1; RVE7
49 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  ASL39; LBD37
50 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  LBD41
51 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  interacts with  --  NZZ; SPL
52 RAV1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2  --  transport  --  Sterol
53 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G63350
54 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BBM
55 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G16350
56 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR2
57 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATWRKY30; WRKY30
58 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB15; ATY19; MYB15
59 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB20; MYB20
60 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYBL2; MYBL2
61 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BZIP45
62 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB97; MYB97
63 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G35560
64 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP16
65 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ANAC055; ATNAC3; NAC055; NAC3
66 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G38300
67 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF12
68 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  HAT1
69 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT4G35610
70 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP3
71 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  anac074; NAC074
72 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G33550
73 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G68670
74 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA13
75 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB73; MYB73
76 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  SOC1
77 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
78 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB3R2; MYB3R-2; MYB3R2; PC-MYB2
79 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA11
80 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR5
81 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G14970
82 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARI1; ATARI1
83 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G44630
84 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  EMF1
85 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BEH4
86 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATTKL; TKL
87 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G55040
88 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR3
89 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  JAZ5
90 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB44
91 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB32; MYB32
92 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB7; ATY49; MYB7
93 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-8
94 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF-7
95 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATERF3
96 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
97 RAV1  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA3
98 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G25550
99 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
100 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATWRKY6; WRKY6
101 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  OBF5
102 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G50680
103 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  GATA16
104 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
105 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ZFP4
106 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RVE1
107 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATZFP10; ZFP10
108 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AGL15
109 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AS1
110 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  CHR4; PKR1
111 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA8
112 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
113 RAV1  --  interacts with  --  TPR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.846075) with  --  GTE4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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