Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATCHS; CHS; TT4
Type: Protein GRN ID: np36241 Name: ATCHS; CHS; TT4
Annotation: CHS, TT4, ATCHS | Chalcone and stilbene synthase family protein [EC:2.3.1.74]
Gene Locus: AT5G13930
Pathways: Auxins;  Ethylene;  Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250207_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATCHS; CHS; TT4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Naringenin chalcone
3 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130
4 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  DFR; M318; TT3
5 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5
6 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3
7 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene
8 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23
9 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1
10 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATWRKY23; WRKY23
11 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971257) with  --  4CL3
12 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.07984) with  --  AT5G05270
13 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06677) with  --  ATFLS1; FLS; FLS1
14 ATCHS; CHS; TT4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Naringenin chalcone  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Malonyl-CoA
15 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  pal4
16 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  pal3
17 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  pal2
18 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  pal1
19 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  ASK13; SK13
20 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  ARR12
21 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  interacts with  --  ARR1
22 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  AT2G44130  --  is the target gene of  --  ath-miR414
23 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  DFR; M318; TT3  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.01583) with  --  AT4G22870
24 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  DFR; M318; TT3  --  has product (in catalytic reaction)  --  (2S)-Flavanone
25 ATCHS; CHS; TT4  --  interacts with  --  DFR; M318; TT3  --  has product (in catalytic reaction)  --  Dihydrokaempferol
26 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATGA2OX2
27 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  BBX22; DBB3; LZF1; STH3
28 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ANS; LDOX; TDS4; TT18
29 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  CYP75B1; D501; TT7
30 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  CHI
31 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATNRT1; B-1; CHL1; CHL1-1; NRT1; NRT1.1
32 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2
33 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  IAA14
34 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AXR2
35 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AtGA20ox1 family92, coding gene
36 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATERF11
37 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  FHL
38 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  FHY1; FRY1; PAT3
39 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ABI5
40 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AB140; CAB1; CAB140; LHCB1.3
41 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AB165; CAB2; LHCB1.1
42 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  is regulated by  --  SPA1
43 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT3G56770
44 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  ATBZIP54; GBF2
45 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G21960
46 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  STH
47 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  pil5
48 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  GBF1
49 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  HYH
50 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AtBBX21; BBX21; LHUS; STH2
51 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  FAR1
52 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  FHY3
53 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  COP1
54 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  FIN219; JAR1
55 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  ATPEX2; PEX2; TED3
56 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1
57 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  CRF1
58 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT4G13040
59 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  MYC3
60 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AtMYB18; MYB18
61 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G48560
62 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT3G23230
63 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  PYE
64 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT1G73870
65 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  BHLH101
66 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G57150
67 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G18450
68 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  BHLH039; ORG3
69 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AtMYB79; MYB79
70 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  CES/CESTA
71 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  AT2G41130
72 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  RAP2.11
73 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  CHD3; CHR6; CKH2; GYM; PKL; SSL2
74 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  interacts with  --  CIP8
75 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  HY5  --  is modified by  --  ATCKA2; CKA2
76 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  regulates the expression of   --  BES1
77 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  regulates the expression of   --  AtCCA1; CCA1
78 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  regulates the expression of   --  RBCS1A
79 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  regulates the expression of   --  LHY; LHY1
80 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  is regulated by  --  della family, transcription factor gene
81 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  ATHDA15; HDA15
82 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  PIF4
83 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  RGL3
84 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  RGL2
85 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  RGL
86 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  RGA1
87 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)
88 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
89 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  AT4G37710
90 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  ATDET1; DET1; FUS2
91 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
92 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  PIF5; PIL6
93 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  PIF3  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1
94 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATMYB12; MYB12; PFG1
95 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  Family86, transcription factor gene
96 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene
97 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF15
98 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-4
99 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-2
100 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-7
101 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF6
102 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF13
103 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-8
104 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF10
105 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-5
106 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF12
107 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF3
108 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ERF104
109 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-9
110 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF1
111 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF14
112 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23  --  interacts with  --  ATMYC1; myc1
113 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23  --  interacts with  --  ATMYC-2; EGL1; EGL3
114 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
115 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23  --  interacts with  --  GL3; GL3; MYC6.2
116 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATTTG1; TTG; TTG1; URM23  --  interacts with  --  ATMYB123; ATTT2; MYB123; TT2
117 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  is regulated by  --  JAZ11
118 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  is regulated by  --  JAZ8
119 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  is regulated by  --  JAZ1
120 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA4
121 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA3
122 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  SPA2
123 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  AT5G62710
124 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  TCP3
125 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  AT4G37130
126 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  TT1; WIP1
127 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
128 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1  --  is the target gene of  --  ath-miR828
129 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATWRKY23; WRKY23  --  is regulated by  --  ARF11
130 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATWRKY23; WRKY23  --  is regulated by  --  ARF7
131 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATWRKY23; WRKY23  --  interacts with  --  AT2G22880
132 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATWRKY23; WRKY23  --  is the target gene of  --  ath-miR1886.1
133 ATCHS; CHS; TT4  --  is regulated by  --  ATWRKY23; WRKY23  --  is the target gene of  --  ath-miR831
134 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971257) with  --  4CL3  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroyl-CoA
135 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971257) with  --  4CL3  --  transport  --  Sulfate
136 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971257) with  --  4CL3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.82588) with  --  A11; CFI; TT5
137 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06677) with  --  ATFLS1; FLS; FLS1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.832016) with  --  F3'H; F3H; TT6
138 ATCHS; CHS; TT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06677) with  --  ATFLS1; FLS; FLS1  --  has product (in catalytic reaction)  --  Flavonol
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact