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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G47420
Type: Protein GRN ID: np36808 Name:
Annotation: Tryptophan RNA-binding attenuator protein-like
Gene Locus: AT5G47420
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 248787_at    
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345
3 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020
4 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1
5 AT5G47420  --  interacts with  --  ATCHX1; CHX1
6 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330
7 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ETR1
8 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ELIP; ELIP1
9 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATRBOH D
10 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  DiT1
11 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATHH2; PIP1;2; PIP1B; TMP-A
12 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AUX1
13 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ALE2
14 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  FOLK
15 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATCOR413-PM1; ATCYP19; COR413-PM1; FL3-5A3; WCOR413; WCOR413-LIKE
16 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  BIL4
17 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  PIN5
18 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
19 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
20 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  PIN4
21 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G20190
22 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AtRLP30; RLP30
23 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ANTR1; PHT4;1
24 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATPPT2; PPT2
25 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT2G26900
26 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ABCI14; TGD1
27 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  PIN6
28 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATOPT1; OPT1
29 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G32410
30 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G55290
31 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G19570
32 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT2G21237
33 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G15610
34 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT2G41610
35 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G27770
36 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G13950
37 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G76185
38 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  EMB1923
39 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G15620
40 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  TET6
41 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  TET11
42 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AtSWEET5; AtVEX1; SWEET5
43 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G54730
44 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G06170
45 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  RTH
46 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  SVL4
47 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  CRK33
48 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G74370
49 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G49230
50 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G29270
51 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G30660
52 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT2G29020
53 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  PDE321; YSL5
54 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G27210
55 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G24000
56 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G36820
57 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AtVHP2;1; AVP2; AVPL1; VHP2;1; VP2
58 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT2G02020
59 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G62200
60 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G64150
61 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G15710
62 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G01230
63 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G53210
64 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G16620
65 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AtMGT3; AtMRS2-5; MGT3; MRS2-5
66 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ATMGT9; MGT9; MRS2-2
67 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G05150
68 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G08890
69 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G35080
70 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G30080
71 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G12950
72 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT4G04480
73 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G10840
74 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT2G01970
75 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  EMB2759
76 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AtENODL15; ENODL15
77 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G07475
78 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  DAD2
79 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  PDLP8
80 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G42370
81 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G03070
82 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  NIP4;1; NLM4
83 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G26110
84 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G15500
85 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ANK1; ATANK1
86 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G51160
87 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G11870
88 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT3G49190
89 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  ABCG10
90 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT1G47670
91 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AATL2; ATLHT2; LHT2
92 AT5G47420  --  interacts with  --  AT5G03345  --  interacts with  --  AT5G41800
93 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G50520
94 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATCESA3
95 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATELP; ATELP1; ATVSR1; BP-80; BP80; BP80-1;1; BP80B; GFS1; VSR1; VSR1;1
96 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATAVP3; AtVHP1;1; AVP-3; AVP1
97 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  EDS5
98 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATMEMB12; MEMB12
99 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ATVIT1; VIT1
100 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ABCG22; AtABCG22
101 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G50290
102 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G52155
103 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G02380
104 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G13266
105 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G11810
106 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G46890
107 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G22830
108 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G57345
109 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G56010
110 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT2G04360
111 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G62400
112 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G23090
113 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  TET15
114 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G46370
115 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G27190
116 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G59730
117 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G27370
118 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G03820
119 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT2G42770
120 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G52600
121 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G53190
122 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G08930
123 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G54320
124 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G03730
125 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G28330
126 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G14670
127 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G22845
128 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G69460
129 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT1G68380
130 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT3G16510
131 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AGP16; ATAGP16
132 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT4G26770
133 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  AT5G55330
134 AT5G47420  --  interacts with  --  AT1G14020  --  interacts with  --  ABCG16
135 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  ATGLR1.1; GLR1; GLR1.1
136 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  PIP1;4; PIP1E; TMP-C
137 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  NIP2;1; NLM4
138 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AAP3; ATAAP3
139 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT2G33250
140 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G75810
141 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G21940
142 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT1G44960
143 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT2G25310
144 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  ATMLO9; MLO9
145 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT5G49130
146 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  AT5G60750
147 AT5G47420  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1  --  interacts with  --  ABCG9
148 AT5G47420  --  interacts with  --  ATCHX1; CHX1  --  interacts with  --  AT4G19865
149 AT5G47420  --  interacts with  --  ATCHX1; CHX1  --  interacts with  --  AT5G07320
150 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  ARFA1D; ATARFA1D
151 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  AT3G25805
152 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  ATMAPR3; ATMP2; MAPR3; MSBP2
153 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  AT2G28315
154 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  AT1G11940
155 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  AT4G38690
156 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  ATCTIMC; CYTOTPI; TPI
157 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
158 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  ATHS1; HS1
159 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
160 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.980348) with  --  AT2G42130
161 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06715) with  --  GDCH
162 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03596) with  --  XK-1; XK1
163 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.12454) with  --  AT1G64680
164 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.09646) with  --  AT1G44920
165 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02426) with  --  ATLFNR2; FNR2
166 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.958849) with  --  AT1G35420
167 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02202) with  --  AT1G76730
168 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.0357) with  --  TAPX
169 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.08267) with  --  AT3G12685
170 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02519) with  --  Deg1; DEGP1
171 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.0146) with  --  DEG5; DEGP5; HHOA
172 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03761) with  --  AT4G27700
173 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.995729) with  --  CYP97C1; LUT1
174 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10225) with  --  HCEF1
175 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.0166) with  --  AT3G56650
176 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00103) with  --  AT5G13720
177 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.88467) with  --  ZFN3
178 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.04262) with  --  ENH1
179 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.955999) with  --  ATMGT10; GMN10; MGT10; MGT10; MRS2-11
180 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05507) with  --  ATPGLP1; PGLP1
181 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05507) with  --  AT5G36790
182 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.12724) with  --  AT5G38520
183 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03685) with  --  AT1G32160
184 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.09847) with  --  AT1G51110
185 AT5G47420  --  interacts with  --  AT2G38330  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.11001) with  --  CSK
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


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