Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AFO; FIL; YAB1
Type: Protein GRN ID: np20780 Name: AFO; FIL; YAB1
Annotation: AFO, FIL, YAB1 | Plant-specific transcription factor YABBY family protein
Gene Locus: AT2G45190
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2C2-YABBY
Pathways: Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245138_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1
3 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3
4 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL
5 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1
6 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.878497) with  --  AtHB33; HB33; ZHD5
7 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.025) with  --  ATHB25; HB25; ZFHD2; ZHD1
8 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  GBF1
9 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AtbZIP68; bZIP68
10 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AtbZIP16; bZIP16
11 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT4G23680
12 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT4G26990
13 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT5G48650
14 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  FRL1
15 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT3G18380
16 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  bHLH121
17 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  LBD18
18 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT2G03640
19 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT1G03457
20 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA
21 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  ACR6
22 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT1G13730
23 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  ATRBP1; RBP1
24 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  GIP1  --  interacts with  --  AT1G67800
25 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  RGA1
26 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  TPR1
27 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  FRS3
28 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  is regulated by  --  ATMYC2
29 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AIB; ATAIB
30 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G01260
31 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  JAZ9
32 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  JAZ4
33 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  KAN; KAN1
34 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT4G15700
35 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AHL20
36 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
37 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT-EXPR; ATEXLB1; ATEXPR1; ATHEXP BETA 3.1; EXLB1; EXPR
38 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G38420
39 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  TOE2
40 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
41 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ROXY2
42 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  CDKC;1
43 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G59210
44 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AO
45 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G60340
46 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  MYC3
47 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  MYC4
48 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  COI1
49 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
50 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G14240
51 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
52 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
53 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G15130
54 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G52695
55 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  PDH-E1 BETA
56 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G67170
57 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G18660
58 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  JAI3  --  is a member of  --  JAI3 family107, transcription factor gene
59 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AT1G35560
60 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
61 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
62 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
63 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AT2G37000
64 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AT2G45680
65 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP8
66 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AT5G23280
67 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  AT5G41030
68 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP1
69 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  ATTCP18; BRC1; TCP18
70 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
71 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TPR3
72 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TPR2
73 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
74 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP17
75 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
76 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP10
77 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
78 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
79 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP5
80 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  TCP3
81 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  INO
82 AFO; FIL; YAB1  --  interacts with  --  NZZ; SPL  --  interacts with  --  YAB3
83 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  interacts with  --  ATKT2; ATKUP2; KT2; KUP2; SHY3; TRK2
84 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  interacts with  --  AtMAPR5; ATMP1; MSBP1
85 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  interacts with  --  ATRBOH D
86 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  transport  --  Selenite
87 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.806434) with  --  AT1G17200
88 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.88944) with  --  AtHB31; HB31; ZHD4
89 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857999) with  --  ER; QRP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.901796) with  --  PDCB3
90 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.878497) with  --  AtHB33; HB33; ZHD5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.85185) with  --  RPB5D
91 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.878497) with  --  AtHB33; HB33; ZHD5  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.905241) with  --  CIL
92 AFO; FIL; YAB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.025) with  --  ATHB25; HB25; ZFHD2; ZHD1  --  interacts with  --  AtHB23; HB23; ZHD10
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact