Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G30230
Type: Protein GRN ID: np17668 Name:
Annotation: Glutathione S-transferase, C-terminal-like;Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6
Gene Locus: AT1G30230
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 265816_s_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3
3 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23
4 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1
5 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3  --  interacts with  --  AtPFA-DSP1; PFA-DSP1
6 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3  --  interacts with  --  AT4G26410
7 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3  --  has product (in catalytic reaction)  --  Formate
8 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3  --  has product (in catalytic reaction)  --  4-Methylthio-2-oxobutanoic acid
9 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3  --  has product (in catalytic reaction)  --  KMB
10 AT1G30230  --  interacts with  --  ARD; ARD3; ATARD3  --  has product (in catalytic reaction)  --  CO
11 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  RPS15
12 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT1G04480
13 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATSYTE; NTMC2T2.1; NTMC2TYPE2.1; SYT5; SYTE
14 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT1G15670
15 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT1G20100
16 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  UGT78D1
17 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  OHP2
18 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
19 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ANNAT1; ATOXY5; OXY5
20 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT1G44920
21 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT1G55150
22 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATDI19; DI19
23 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT1G69460
24 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATWHY2; WHY2
25 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AtkdsA1
26 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  EXGT-A1; EXT; XTH4
27 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  RD2
28 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT2G23090
29 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT2G32240
30 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT2G37190
31 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  cdf3; LP2; LTP2
32 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT3G05500
33 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  PLD; PLDALPHA1
34 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATEHD1; EHD1
35 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ABI3
36 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AIG2
37 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT3G53990
38 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT4G07940
39 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT4G12510
40 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  UNE16
41 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATRBP31; ATRBP33; CP31; RBP31
42 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  LECRKA4.1
43 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G01800
44 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATEXO70A1; EXO70A1
45 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATSED5; ATSYP31; SED5; SYP31
46 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G10860
47 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AtGILP; GILP
48 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  CCH/CHLH/GUN5
49 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G14240
50 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G18050
51 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
52 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  PHL1
53 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G39410
54 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  NDL1
55 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G59105
56 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G62360
57 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  RPS28
58 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  AT5G65495
59 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  LysoPL2
60 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  interacts with  --  ATPDI2; ATPDIL1-4; PDI2; PDIL1-4
61 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.974052) with  --  AT1G33050
62 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.91776) with  --  AT1G26665
63 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.816265) with  --  TRFL6
64 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.805173) with  --  AT3G10770
65 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.823708) with  --  AT4G09830
66 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.981181) with  --  AT4G25170
67 AT1G30230  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.811022) with  --  AT5G50230
68 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  regulates the expression of   --  PR1
69 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  emb2386
70 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT1G13350
71 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT-EXP1; ATEXP1; ATEXPA1; ATHEXP ALPHA 1.2; EXP1; EXPA1
72 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  OTC
73 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT2G02510
74 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT2G21580
75 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT3G01820
76 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT3G20390
77 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ALDH2; ALDH2A; ALDH2B4
78 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT3G53190
79 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT4G15160
80 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT4G16450
81 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT4G18100
82 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ATGLB3; GLB3
83 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT5G02450
84 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  EMB3010; RPS6B
85 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ATSPX1; SPX1
86 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  RUG2
87 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  HCT
88 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ATRBP45A; RBP45A
89 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2
90 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ADF3
91 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT5G66930
92 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ASK3; SK3
93 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  AT2G38300
94 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  ATNPR4; NPR4
95 AT1G30230  --  interacts with  --  TGA1  --  interacts with  --  NPR1 /NIM1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact