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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node CAL
Type: Protein GRN ID: np06086 Name: CAL
Annotation: CAL, CAL1, AGL10 | K-box region and MADS-box transcription factor family protein [TCDB:9.A.14.1]
Gene Locus: AT1G26310
Transcription factor /
transcriptional regulator:
transcription factor family MADS-MIKC
Pathways: Gibberellins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245819_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 CAL  --  interacts with  --  AGL24
3 CAL  --  interacts with  --  AGL22; SVP
4 CAL  --  interacts with  --  SOC1
5 CAL  --  interacts with  --  AGL9; SEP3
6 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150
7 CAL  --  is regulated by  --  ALC
8 CAL  --  is regulated by  --  LFY
9 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL21
10 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL16
11 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL14
12 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  ful
13 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  ap1
14 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL6
15 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL1; SHP1
16 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AG
17 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL15
18 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  AGL2; SEP1
19 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  IMK3; MRLK
20 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  is regulated by  --  FD
21 CAL  --  interacts with  --  AGL24  --  is regulated by  --  FT?
22 CAL  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  AGL27; FLM; MAF1
23 CAL  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  ATJ; ATJ3; J3
24 CAL  --  interacts with  --  AGL22; SVP  --  interacts with  --  FLC
25 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  regulates the expression of   --  CBFS
26 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  RID3
27 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AT5G47590
28 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL71
29 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL44; ANR1
30 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL42
31 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL19; GL19
32 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL17
33 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL13
34 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL12; XAL1
35 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL5; SHP2
36 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL4; SEP2
37 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AGL3; SEP4
38 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  AT2G24550
39 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  ARR14
40 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  TPR3
41 CAL  --  interacts with  --  SOC1  --  interacts with  --  TPR2
42 CAL  --  interacts with  --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  AGL11; STK
43 CAL  --  interacts with  --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  ABS; AGL32; TT16
44 CAL  --  interacts with  --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  SEU
45 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL26
46 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL103
47 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL101
48 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL96
49 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL90
50 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL87
51 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL82
52 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL78
53 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL77
54 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL72
55 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL65
56 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL56
57 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL55
58 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL52
59 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL49
60 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL43
61 CAL  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  ATSWI3B?
62 CAL  --  is regulated by  --  ALC  --  is regulated by  --  della family, transcription factor gene
63 CAL  --  is regulated by  --  ALC  --  interacts with  --  RGL2
64 CAL  --  is regulated by  --  ALC  --  interacts with  --  RGA1
65 CAL  --  is regulated by  --  ALC  --  interacts with  --  ACI1
66 CAL  --  is regulated by  --  ALC  --  interacts with  --  HLH1; PAR1
67 CAL  --  is regulated by  --  ALC  --  interacts with  --  spatula
68 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  is regulated by  --  spl family, transcription factor gene
69 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33
70 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  is regulated by  --  GBF1
71 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD
72 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  interacts with  --  MYB17
73 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  interacts with  --  UFO
74 CAL  --  is regulated by  --  LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


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